14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0467 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0467  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  205  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62565  normal  0.624691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00378  conserved hypothetical protein  97.09 
 
 		 125 aa  202  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00680553  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0502  hypothetical protein  97.09 
 
 		 119 aa  201  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.145396  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0462  hypothetical protein  97.09 
 
 		 119 aa  201  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.129504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00382  hypothetical protein  97.09 
 
 		 119 aa  201  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00876967  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3387  hypothetical protein  41.46 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  34.57 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  32.05 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  32.98 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  32.1 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  32.1 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  35.37 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  29.11 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1730  Protein of unknown function DUF1778  29.63 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264172  normal  0.231757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>