35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2344 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  189  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  40.96 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  46.75 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  42.42 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  39.74 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  35.71 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  38.67 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  36.36 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  37.65 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0502  hypothetical protein  32.05 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.145396  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00382  hypothetical protein  32.05 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00876967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0467  hypothetical protein  32.05 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62565  normal  0.624691 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  36.36 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0462  hypothetical protein  32.05 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.129504  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00378  conserved hypothetical protein  32.05 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00680553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0499  Protein of unknown function DUF1778  33.71 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.92747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  36 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  37.18 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  32.94 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  36.25 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  26.67 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  31.17 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  31.17 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  32.89 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  28.21 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  29.89 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0764  hypothetical protein  34.67 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0915  hypothetical protein  34.67 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0663425  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  34.88 
 
 		 102 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  35.44 
 
 		 92 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  30.88 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4306  Protein of unknown function DUF1778  33.73 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.956643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  32.05 
 
 		 96 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>