20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1171 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1171  CopG-like DNA-binding  100 
 
 		 92 aa  175  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.693906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2169  hypothetical protein  67.42 
 
 		 135 aa  120  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  46.15 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  45.68 
 
 		 101 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1718  Protein of unknown function DUF1778  35.87 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  36.59 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  37.21 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3866  hypothetical protein  37.04 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0400  Protein of unknown function DUF1778  33.75 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00028613  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4035  hypothetical protein  35.8 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64384  normal  0.367724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3847  putative cytoplasmic protein  35.8 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3975  hypothetical protein  35.8 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4243  hypothetical protein  34.57 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  33.33 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2145  Protein of unknown function DUF1778  36.71 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0067  hypothetical protein  34.18 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0712969  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  32.05 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3542  Protein of unknown function DUF1778  33.33 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3703  Protein of unknown function DUF1778  33.33 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1730  Protein of unknown function DUF1778  32.18 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264172  normal  0.231757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>