14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2169 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2169  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  270  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1171  CopG-like DNA-binding  67.42 
 
 		 92 aa  120  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.693906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  41.76 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  42.57 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1718  Protein of unknown function DUF1778  38.1 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0400  Protein of unknown function DUF1778  39.24 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00028613  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  35.9 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4586  CopG-like DNA-binding  34.62 
 
 		 96 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  26.92 
 
 		 92 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  34.62 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3542  Protein of unknown function DUF1778  34.67 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3703  Protein of unknown function DUF1778  34.67 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  34.18 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  33.33 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>