35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1718 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1718  Protein of unknown function DUF1778  100 
 
 		 92 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  59.55 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  46.07 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  44.71 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  40.22 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0400  Protein of unknown function DUF1778  41.18 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00028613  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1730  Protein of unknown function DUF1778  39.36 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264172  normal  0.231757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1171  CopG-like DNA-binding  35.87 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.693906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  35.37 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2169  hypothetical protein  38.1 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  37.33 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2145  Protein of unknown function DUF1778  39.24 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  28.89 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  35.9 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  35.9 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  31.87 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4586  CopG-like DNA-binding  36 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  32 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  35.8 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4035  hypothetical protein  32 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64384  normal  0.367724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3847  putative cytoplasmic protein  32 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3975  hypothetical protein  32 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3866  hypothetical protein  32 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4243  hypothetical protein  32 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  43.75 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0067  hypothetical protein  32 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0712969  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1137  Protein of unknown function DUF1778  32.1 
 
 		 90 aa  43.9  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1418  hypothetical protein  32.1 
 
 		 90 aa  43.9  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0512849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3542  Protein of unknown function DUF1778  28.4 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1572  hypothetical protein  27.91 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3703  Protein of unknown function DUF1778  28.4 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0837  hypothetical protein  27.16 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4726  hypothetical protein  32.84 
 
 		 92 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  28.41 
 
 		 97 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>