51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1572 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1572  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  189  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  75.86 
 
 		 97 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4572  hypothetical protein  69.47 
 
 		 97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0336291  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3548  Protein of unknown function DUF1778  70 
 
 		 97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3430  Protein of unknown function DUF1778  70.79 
 
 		 97 aa  113  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.410237  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3083  Protein of unknown function DUF1778  70 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4712  hypothetical protein  68.42 
 
 		 97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4663  hypothetical protein  68.42 
 
 		 97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.316617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2043  hypothetical protein  62.11 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0191203  hitchhiker  0.00751766 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4586  CopG-like DNA-binding  54.65 
 
 		 96 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1137  Protein of unknown function DUF1778  48.78 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1418  hypothetical protein  48.78 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0512849  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0280  hypothetical protein  53.33 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3542  Protein of unknown function DUF1778  45.45 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1355  hypothetical protein  48.42 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1784  hypothetical protein  38.27 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0946  hypothetical protein  41.98 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.583397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3703  Protein of unknown function DUF1778  45.68 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4726  hypothetical protein  43.82 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  36.17 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  36.17 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  41.94 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  38.46 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  36.78 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  35.11 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  39.29 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2145  Protein of unknown function DUF1778  41.18 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0122  hypothetical protein  41.57 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  37.35 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0114  Protein of unknown function DUF1778  40.45 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0846  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418454  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0067  hypothetical protein  38.27 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0712969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  39.02 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3866  hypothetical protein  38.27 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3975  hypothetical protein  38.27 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4035  hypothetical protein  38.27 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64384  normal  0.367724 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0301  hypothetical protein  34.74 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00707252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3847  putative cytoplasmic protein  38.27 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  30.77 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4243  hypothetical protein  37.04 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3049  hypothetical protein  54.35 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5374  Protein of unknown function DUF1778  33.72 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0668573  normal  0.988789 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  39.74 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  34.18 
 
 		 102 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  31.46 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  32.5 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  30.49 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1718  Protein of unknown function DUF1778  27.91 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  34.15 
 
 		 92 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1648  helix-turn-helix protein, CopG  45.1 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.519385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>