63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39810 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  189  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1572  hypothetical protein  75.86 
 
 		 94 aa  133  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3548  Protein of unknown function DUF1778  64.95 
 
 		 97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3430  Protein of unknown function DUF1778  64.95 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.410237  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3083  Protein of unknown function DUF1778  63.92 
 
 		 97 aa  110  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4712  hypothetical protein  64.95 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4663  hypothetical protein  64.95 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.316617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4572  hypothetical protein  63.92 
 
 		 97 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0336291  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2043  hypothetical protein  58.76 
 
 		 97 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0191203  hitchhiker  0.00751766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0280  hypothetical protein  54.46 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4586  CopG-like DNA-binding  51.19 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1418  hypothetical protein  44.19 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0512849  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1137  Protein of unknown function DUF1778  44.19 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1784  hypothetical protein  38.37 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  41.46 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  41.46 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  40.62 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  40.24 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  39.58 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0846  hypothetical protein  38.14 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  40.48 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0946  hypothetical protein  38.82 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.583397  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  40.23 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2145  Protein of unknown function DUF1778  44.32 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4243  hypothetical protein  43.9 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  37.21 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3703  Protein of unknown function DUF1778  41.46 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3542  Protein of unknown function DUF1778  41.46 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1355  hypothetical protein  42.55 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4035  hypothetical protein  42.68 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64384  normal  0.367724 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3975  hypothetical protein  42.68 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3847  putative cytoplasmic protein  42.68 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3866  hypothetical protein  42.68 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5374  Protein of unknown function DUF1778  34.41 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0668573  normal  0.988789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  39.08 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4726  hypothetical protein  40.48 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3049  hypothetical protein  35.05 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  36.78 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0067  hypothetical protein  40.24 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0712969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  40 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  39.53 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0301  hypothetical protein  35.29 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00707252  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0122  hypothetical protein  36.9 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0114  Protein of unknown function DUF1778  35.71 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  34.52 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  34.94 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  35 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  32.05 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1648  helix-turn-helix protein, CopG  48 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.519385  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  34.15 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0499  Protein of unknown function DUF1778  31.51 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.92747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  34.83 
 
 		 102 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  32.56 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  34.67 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  34.25 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  32.88 
 
 		 92 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  32.88 
 
 		 93 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  32.88 
 
 		 93 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  32.88 
 
 		 93 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  32.88 
 
 		 93 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1718  Protein of unknown function DUF1778  28.41 
 
 		 92 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  35.29 
 
 		 93 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>