43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0122 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0122  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  187  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0114  Protein of unknown function DUF1778  96.74 
 
 		 92 aa  179  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4726  hypothetical protein  83.7 
 
 		 92 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3542  Protein of unknown function DUF1778  60.87 
 
 		 90 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3703  Protein of unknown function DUF1778  60.71 
 
 		 83 aa  107  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1137  Protein of unknown function DUF1778  51.72 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1418  hypothetical protein  51.72 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0512849  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0301  hypothetical protein  47.73 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00707252  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0946  hypothetical protein  48.84 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.583397  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1784  hypothetical protein  42.53 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3866  hypothetical protein  44.58 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4035  hypothetical protein  43.37 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64384  normal  0.367724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3847  putative cytoplasmic protein  43.37 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3975  hypothetical protein  43.37 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0067  hypothetical protein  42.17 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0712969  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4243  hypothetical protein  43.37 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  42.17 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  50.79 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  39.77 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  38.89 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4586  CopG-like DNA-binding  43.9 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  49.21 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1572  hypothetical protein  41.57 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  36.96 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  36.96 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  35.87 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5374  Protein of unknown function DUF1778  34.48 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0668573  normal  0.988789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4663  hypothetical protein  42.39 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.316617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3548  Protein of unknown function DUF1778  42.86 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214549  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4712  hypothetical protein  42.39 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0280  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1355  hypothetical protein  41.3 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4572  hypothetical protein  41.3 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0336291  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3083  Protein of unknown function DUF1778  41.57 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3430  Protein of unknown function DUF1778  41.57 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.410237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2043  hypothetical protein  39.76 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0191203  hitchhiker  0.00751766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  36.9 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  38.36 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2145  Protein of unknown function DUF1778  37.35 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1648  helix-turn-helix protein, CopG  45.45 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.519385  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  36.51 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1730  Protein of unknown function DUF1778  32.89 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264172  normal  0.231757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  31.34 
 
 		 92 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>