49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3975 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3975  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  177  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3847  putative cytoplasmic protein  100 
 
 
88 aa  177  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4035  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  177  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64384  normal  0.367724 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3866  hypothetical protein  96.59 
 
 
88 aa  173  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4243  hypothetical protein  92.05 
 
 
88 aa  165  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0067  hypothetical protein  88.64 
 
 
94 aa  159  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0712969  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3542  Protein of unknown function DUF1778  54.76 
 
 
90 aa  98.6  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3703  Protein of unknown function DUF1778  56.79 
 
 
83 aa  97.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0301  hypothetical protein  48.15 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00707252  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0946  hypothetical protein  44.71 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.583397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4726  hypothetical protein  48.19 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  43.37 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1137  Protein of unknown function DUF1778  44.44 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1784  hypothetical protein  43.21 
 
 
87 aa  75.9  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1418  hypothetical protein  44.44 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0512849  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  44.44 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0114  Protein of unknown function DUF1778  43.37 
 
 
92 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  43.75 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  43.21 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0122  hypothetical protein  43.37 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  42.5 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2145  Protein of unknown function DUF1778  42.53 
 
 
90 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  31.4 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  42.68 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  31.4 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  31.4 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4586  CopG-like DNA-binding  37.65 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1572  hypothetical protein  38.27 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271539  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2043  hypothetical protein  39.51 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0191203  hitchhiker  0.00751766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3548  Protein of unknown function DUF1778  39.51 
 
 
97 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214549  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  34.18 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3083  Protein of unknown function DUF1778  39.51 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1730  Protein of unknown function DUF1778  36.36 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264172  normal  0.231757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  34.15 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  37.35 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0280  hypothetical protein  37.04 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3430  Protein of unknown function DUF1778  38.27 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.410237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4712  hypothetical protein  38.27 
 
 
97 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0574447  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4663  hypothetical protein  38.27 
 
 
97 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.316617  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4572  hypothetical protein  37.04 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0336291  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1355  hypothetical protein  37.04 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  32.89 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1171  CopG-like DNA-binding  35.8 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.693906  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1718  Protein of unknown function DUF1778  32 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0400  Protein of unknown function DUF1778  32.86 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00028613  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5374  Protein of unknown function DUF1778  26.44 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0668573  normal  0.988789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1648  helix-turn-helix protein, CopG  44.44 
 
 
114 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.519385  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0837  hypothetical protein  25.58 
 
 
88 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>