40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3908 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3908  Protein of unknown function DUF1778  100 
 
 		 93 aa  186  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  39.29 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  36.36 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1730  Protein of unknown function DUF1778  33.7 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264172  normal  0.231757 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  38.46 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  34.52 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1784  hypothetical protein  37.18 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0307967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1718  Protein of unknown function DUF1778  28.89 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0946  hypothetical protein  34.67 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.583397  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1171  CopG-like DNA-binding  36.59 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.693906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4243  hypothetical protein  32.89 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  37.18 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3975  hypothetical protein  32.89 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3847  putative cytoplasmic protein  32.89 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4035  hypothetical protein  32.89 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64384  normal  0.367724 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  29.41 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1418  hypothetical protein  34.18 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0512849  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1137  Protein of unknown function DUF1778  34.18 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3542  Protein of unknown function DUF1778  32.05 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0400  Protein of unknown function DUF1778  30.34 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00028613  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3703  Protein of unknown function DUF1778  32.05 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  31.58 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  34.83 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3866  hypothetical protein  32.89 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0067  hypothetical protein  31.58 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0712969  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0301  hypothetical protein  28.95 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00707252  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  34.83 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  30.49 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  33.71 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1351  Protein of unknown function DUF1778  31.65 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.513418  hitchhiker  0.0017471 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  30.95 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2169  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  29.76 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2145  Protein of unknown function DUF1778  34.62 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  32.43 
 
 		 113 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0837  hypothetical protein  31.51 
 
 		 88 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346325 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  31.08 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  34.12 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  32.88 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  32.88 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>