18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0499 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0499  Protein of unknown function DUF1778  100 
 
 		 90 aa  172  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.92747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  33.71 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  30.49 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  30.49 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  36.99 
 
 		 95 aa  47.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  37.36 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  34.48 
 
 		 90 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  36.14 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  34.48 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  36.11 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39810  hypothetical protein  31.51 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443766  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  31.76 
 
 		 155 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4586  CopG-like DNA-binding  34.92 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  34.48 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  31.76 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  30.95 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  26.32 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  28.57 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>