39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02185 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  233  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  42.53 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  42.53 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  34.94 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  43.68 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  35.71 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  39.76 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  40.7 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  35.58 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  37.35 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  39.78 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  35.44 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0764  hypothetical protein  44.83 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0915  hypothetical protein  44.83 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0663425  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  35.29 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  36.14 
 
 		 102 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  35.8 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  35.37 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  38.81 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  35.37 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  36.47 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  35.8 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  35.23 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  35.23 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  38.27 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  36.49 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  37.8 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  40.54 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  30.34 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0499  Protein of unknown function DUF1778  34.48 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.92747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4606  hypothetical protein  31.76 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.902033 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4404  Protein of unknown function DUF1778  31.76 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.590781 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4423  hypothetical protein  31.76 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000193282  normal  0.061547 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1137  Protein of unknown function DUF1778  32.47 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  29.73 
 
 		 93 aa  40  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  29.73 
 
 		 93 aa  40  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1418  hypothetical protein  32.47 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0512849  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  29.73 
 
 		 93 aa  40  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  29.73 
 
 		 93 aa  40  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>