33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0764 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0764  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  176  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0915  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  176  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0663425  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  95.56 
 
 		 91 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  86.67 
 
 		 90 aa  157  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  70 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4404  Protein of unknown function DUF1778  44.58 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.590781 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4606  hypothetical protein  44.58 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.902033 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4423  hypothetical protein  44.58 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000193282  normal  0.061547 
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  44.83 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  36.67 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  43.08 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  36.92 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  36.99 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  36.14 
 
 		 100 aa  48.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  34.67 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  33.33 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  39.47 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  32.5 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  32.91 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  36 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  29.63 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  30.56 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  30.56 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  30.56 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  30.56 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  40.28 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  37.65 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0499  Protein of unknown function DUF1778  34.72 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.92747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  31.94 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  35.9 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  36.84 
 
 		 140 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>