30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2494 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  208  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  45.59 
 
 
95 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  35.8 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  42.86 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  42.42 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  41.18 
 
 
91 aa  57.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  40 
 
 
90 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  38.03 
 
 
92 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  38.57 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  40.3 
 
 
89 aa  53.5  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  39.47 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  37.14 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  39.71 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  38.46 
 
 
95 aa  50.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  38.81 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  39.71 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  41.82 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  41.82 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0915  hypothetical protein  43.08 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0663425  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0764  hypothetical protein  43.08 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  40.91 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  40.3 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  34.29 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  35.53 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  39.06 
 
 
158 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  32.35 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  32.35 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  34.15 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  37.5 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  35.94 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>