49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3599 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  202  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  39.51 
 
 
92 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2344  hypothetical protein  46.75 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  38.89 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  42.86 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  38.89 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4423  hypothetical protein  32.58 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000193282  normal  0.061547 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4606  hypothetical protein  32.58 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.902033 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4404  Protein of unknown function DUF1778  32.58 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.590781 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  36.11 
 
 
91 aa  53.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  33.68 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  32.93 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  35.96 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  33.67 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2943  hypothetical protein  32.29 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.197076  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  35.44 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  34.94 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  31.87 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  38.55 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  33.75 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  31.82 
 
 
102 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  33.75 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  29.07 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  34.57 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  30.38 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  29.87 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  29.87 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  29.87 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  29.87 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3137  hypothetical protein  32 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  34.29 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  24.73 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0915  hypothetical protein  36.92 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0663425  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  32.53 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  34.72 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0764  hypothetical protein  36.92 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  32.53 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  32.53 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  32.94 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  31.65 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3271  hypothetical protein  30.67 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0819  hypothetical protein  30.67 
 
 
99 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104173  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  31.65 
 
 
99 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  30.95 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  29.33 
 
 
140 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3552  hypothetical protein  37.68 
 
 
95 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0499  Protein of unknown function DUF1778  28.57 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.92747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>