31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3839 on replicon NC_008608
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008608  Ppro_3839  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  54.95 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  52.81 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  48.31 
 
 		 93 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  48.31 
 
 		 93 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  48.31 
 
 		 93 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  48.31 
 
 		 93 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  50.56 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4306  Protein of unknown function DUF1778  56.18 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.956643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  41.67 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  41.67 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  39.47 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  37.04 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  34.18 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  32.05 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  30.38 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  32 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  31.17 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  33.78 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  35.44 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  35.14 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  37.84 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10936  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  30.56 
 
 		 91 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  34.57 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  33.8 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  30.26 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  32.14 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0499  Protein of unknown function DUF1778  26.32 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.92747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>