26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4423 on replicon NC_009661
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011664  Sbal223_4404  Protein of unknown function DUF1778  100 
 
 		 97 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.590781 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4606  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.902033 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4423  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000193282  normal  0.061547 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  43.37 
 
 		 90 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  44.3 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0637  hypothetical protein  45 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  34.48 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  32.58 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  39.02 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0764  hypothetical protein  45 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0915  hypothetical protein  45 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0663425  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  34.12 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  32.95 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  31.76 
 
 		 94 aa  50.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  34.52 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1843  Protein of unknown function DUF1778  31.65 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  41.43 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  30.77 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5176  Protein of unknown function DUF1778  30.49 
 
 		 99 aa  42.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  27.78 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2077  Protein of unknown function DUF1778  32.43 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  27.85 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  27.85 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  27.85 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  27.85 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_003296  RS02185  hypothetical protein  31.76 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>