21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2943 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2943  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  197  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.197076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  57.95 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  58.93 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  49.32 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  52.94 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  50.67 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  55.17 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  48.48 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  47.3 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  42.86 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  47.3 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  46.38 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  41.79 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  32.29 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  36.67 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  35.21 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  36.07 
 
 		 92 aa  47.4  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  38.24 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  41.67 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  34.43 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.642193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>