More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0675 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  68.8 
 
 		 593 aa  787    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  59.56 
 
 		 581 aa  690    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  68.3 
 
 		 595 aa  782    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  58.72 
 
 		 588 aa  700    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  73.99 
 
 		 595 aa  798    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  56.86 
 
 		 588 aa  666    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  73.33 
 
 		 437 aa  647    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  60.37 
 
 		 586 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  59.59 
 
 		 588 aa  702    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  59.97 
 
 		 586 aa  702    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 596 aa  1183    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  48.15 
 
 		 586 aa  518  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  49.45 
 
 		 577 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  50.62 
 
 		 648 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  46.13 
 
 		 580 aa  489  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  50.54 
 
 		 624 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  50.54 
 
 		 624 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  50.36 
 
 		 624 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  50.09 
 
 		 625 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  50.63 
 
 		 626 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  49.73 
 
 		 626 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  50.09 
 
 		 596 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  50.09 
 
 		 598 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  48.58 
 
 		 625 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  52.06 
 
 		 571 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  46.08 
 
 		 653 aa  462  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  49.38 
 
 		 596 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  49.29 
 
 		 596 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  47.69 
 
 		 610 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  48.48 
 
 		 624 aa  448  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  48.5 
 
 		 575 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  46.94 
 
 		 618 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  47.73 
 
 		 623 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  47.73 
 
 		 623 aa  428  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  48.8 
 
 		 588 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  46.9 
 
 		 619 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  47.53 
 
 		 621 aa  422  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  48.32 
 
 		 583 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  47.94 
 
 		 627 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  47.94 
 
 		 627 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  47.1 
 
 		 599 aa  411  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  47.76 
 
 		 627 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  47.58 
 
 		 692 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  47.58 
 
 		 627 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  47.76 
 
 		 627 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  48.04 
 
 		 628 aa  411  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  47.58 
 
 		 626 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  45.53 
 
 		 634 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  45.53 
 
 		 634 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  45.53 
 
 		 634 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  45.13 
 
 		 623 aa  399  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  44.36 
 
 		 572 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  43.08 
 
 		 662 aa  398  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  46.06 
 
 		 629 aa  395  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  43.01 
 
 		 658 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  42.91 
 
 		 669 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  41.5 
 
 		 582 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  46.19 
 
 		 648 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  43.58 
 
 		 643 aa  382  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  42.58 
 
 		 652 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  42.02 
 
 		 662 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  42.2 
 
 		 662 aa  364  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  42.08 
 
 		 691 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  40.37 
 
 		 616 aa  356  5.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  42.02 
 
 		 660 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  41.57 
 
 		 661 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  41.57 
 
 		 661 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  41.4 
 
 		 661 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  42.02 
 
 		 696 aa  350  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  36.73 
 
 		 576 aa  340  4e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14390  gamma-glutamyltransferase 1  43.69 
 
 		 612 aa  330  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  42.44 
 
 		 614 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5232  gamma-glutamyltransferase  43.94 
 
 		 605 aa  319  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  36.84 
 
 		 589 aa  312  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2007  gamma-glutamyltransferase  40.34 
 
 		 613 aa  310  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408979  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  39 
 
 		 578 aa  310  5e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2332  gamma-glutamyltransferase  44.05 
 
 		 602 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  40.28 
 
 		 579 aa  306  7e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  38.18 
 
 		 586 aa  306  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3760  gamma-glutamyltransferase  41.61 
 
 		 620 aa  303  7.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5929  gamma-glutamyltransferase  39.52 
 
 		 628 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  39.96 
 
 		 595 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  39.82 
 
 		 590 aa  295  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  37.1 
 
 		 587 aa  294  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  35.34 
 
 		 576 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  35.83 
 
 		 593 aa  291  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  36.98 
 
 		 580 aa  290  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  40 
 
 		 601 aa  290  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  35.51 
 
 		 606 aa  290  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  35.08 
 
 		 576 aa  289  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  34.88 
 
 		 581 aa  287  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  39.78 
 
 		 583 aa  287  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  35.42 
 
 		 556 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  35.73 
 
 		 571 aa  282  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  35.93 
 
 		 576 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  39.6 
 
 		 586 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  36.4 
 
 		 578 aa  282  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  35.93 
 
 		 576 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  34.88 
 
 		 556 aa  281  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  34.28 
 
 		 645 aa  280  5e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>