More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2546 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  55.78 
 
 		 669 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  56.13 
 
 		 652 aa  674    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  57.69 
 
 		 648 aa  661    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  57.05 
 
 		 634 aa  682    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  57.05 
 
 		 634 aa  682    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 658 aa  1324    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  57.05 
 
 		 634 aa  682    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  55.34 
 
 		 643 aa  683    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  55.37 
 
 		 616 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  51.53 
 
 		 662 aa  598  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  52.59 
 
 		 696 aa  590  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  53.27 
 
 		 662 aa  588  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  53.27 
 
 		 662 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  53.77 
 
 		 660 aa  581  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  53.6 
 
 		 691 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  52.93 
 
 		 661 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  52.93 
 
 		 661 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  52.76 
 
 		 661 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  48.31 
 
 		 625 aa  475  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  46 
 
 		 625 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  47.47 
 
 		 648 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  45.78 
 
 		 623 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  43.62 
 
 		 653 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  45.25 
 
 		 624 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  45.25 
 
 		 624 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  46.15 
 
 		 624 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  45.78 
 
 		 623 aa  465  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  47.13 
 
 		 626 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  43.84 
 
 		 618 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  46.14 
 
 		 626 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  45.89 
 
 		 624 aa  458  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  44.89 
 
 		 596 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  44.39 
 
 		 610 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  44.5 
 
 		 596 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  44.5 
 
 		 598 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  44.57 
 
 		 596 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  45.68 
 
 		 628 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  41.79 
 
 		 581 aa  432  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  43.02 
 
 		 621 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  42.08 
 
 		 599 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  42.95 
 
 		 586 aa  428  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  44.75 
 
 		 593 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  46.87 
 
 		 627 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  44.08 
 
 		 577 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  44.58 
 
 		 595 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  46.87 
 
 		 627 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  43.81 
 
 		 623 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  47.05 
 
 		 692 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  46.69 
 
 		 627 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  46.69 
 
 		 627 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  46.87 
 
 		 627 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  41.25 
 
 		 586 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  46.87 
 
 		 626 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  40.2 
 
 		 588 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  40.27 
 
 		 588 aa  412  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  45.89 
 
 		 629 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  43.57 
 
 		 595 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  41.04 
 
 		 580 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  40.7 
 
 		 586 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  38.79 
 
 		 588 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  42.01 
 
 		 596 aa  395  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  42.88 
 
 		 572 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  44.35 
 
 		 588 aa  391  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  42.46 
 
 		 571 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  40.17 
 
 		 582 aa  362  9e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  40.42 
 
 		 583 aa  347  4e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  38.79 
 
 		 575 aa  336  9e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  39.13 
 
 		 619 aa  330  6e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  42.68 
 
 		 437 aa  316  7e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  32.41 
 
 		 576 aa  293  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  34.21 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  33.28 
 
 		 583 aa  274  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  36.42 
 
 		 601 aa  272  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  36.55 
 
 		 590 aa  263  8.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  37.23 
 
 		 614 aa  262  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  35.49 
 
 		 579 aa  261  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  32.38 
 
 		 645 aa  255  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14390  gamma-glutamyltransferase 1  34.22 
 
 		 612 aa  254  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  31.75 
 
 		 589 aa  253  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5232  gamma-glutamyltransferase  35.05 
 
 		 605 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  31.71 
 
 		 599 aa  252  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  33.8 
 
 		 586 aa  252  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  31.31 
 
 		 581 aa  251  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  32.12 
 
 		 645 aa  250  6e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  32.35 
 
 		 579 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2007  gamma-glutamyltransferase  34.57 
 
 		 613 aa  247  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408979  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  31.6 
 
 		 590 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3760  gamma-glutamyltransferase  34.91 
 
 		 620 aa  244  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  31.83 
 
 		 579 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  32.3 
 
 		 606 aa  243  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  31.83 
 
 		 579 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  31.65 
 
 		 579 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  31.65 
 
 		 579 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  33.68 
 
 		 586 aa  243  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  31.67 
 
 		 617 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  31.83 
 
 		 583 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  31.08 
 
 		 579 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  31.71 
 
 		 556 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  30.77 
 
 		 576 aa  238  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  32.23 
 
 		 580 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>