More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2394 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  56.97 
 
 
662 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  57.05 
 
 
658 aa  692    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  100 
 
 
634 aa  1274    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  100 
 
 
634 aa  1274    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  68.51 
 
 
643 aa  861    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  59.33 
 
 
669 aa  676    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  57.55 
 
 
662 aa  663    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  61.64 
 
 
652 aa  742    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  100 
 
 
634 aa  1274    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  73.14 
 
 
648 aa  854    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  55.19 
 
 
696 aa  634  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  56.64 
 
 
660 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  56.3 
 
 
691 aa  624  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  56.97 
 
 
662 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  56.81 
 
 
661 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  56.81 
 
 
661 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  56.64 
 
 
661 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  55.89 
 
 
616 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  47.52 
 
 
624 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  47.83 
 
 
648 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  47.52 
 
 
624 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  47.52 
 
 
624 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  46.71 
 
 
625 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  47.52 
 
 
625 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  46.97 
 
 
598 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  47.03 
 
 
626 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  47.27 
 
 
653 aa  475  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  47.36 
 
 
626 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  46.5 
 
 
596 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  47.11 
 
 
610 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  47.19 
 
 
596 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  46.43 
 
 
596 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  45.18 
 
 
623 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  45.18 
 
 
623 aa  464  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  45.32 
 
 
599 aa  458  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  45.3 
 
 
618 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  45.19 
 
 
628 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  44.63 
 
 
586 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  43.7 
 
 
624 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  45.29 
 
 
621 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  42.91 
 
 
581 aa  432  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  42.5 
 
 
586 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  45.31 
 
 
627 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  45.31 
 
 
627 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  45.31 
 
 
627 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  45.31 
 
 
692 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  45.04 
 
 
629 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  45.49 
 
 
627 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  45.49 
 
 
626 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  45.31 
 
 
627 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  44 
 
 
623 aa  415  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  44.98 
 
 
593 aa  412  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  39.57 
 
 
588 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  44.81 
 
 
595 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  41.9 
 
 
577 aa  409  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  40.41 
 
 
588 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  45.53 
 
 
596 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  40.68 
 
 
588 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  46.02 
 
 
588 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  40.83 
 
 
580 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  39.46 
 
 
586 aa  399  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  43.25 
 
 
595 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  42.76 
 
 
572 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  44.5 
 
 
571 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  43.78 
 
 
583 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  42.43 
 
 
575 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  41.67 
 
 
619 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  38.46 
 
 
582 aa  350  5e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  41.61 
 
 
437 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  38.51 
 
 
578 aa  294  4e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  33.87 
 
 
645 aa  274  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  32.98 
 
 
599 aa  273  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  33.51 
 
 
645 aa  273  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  33.51 
 
 
581 aa  272  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  38.97 
 
 
601 aa  270  5e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  33.69 
 
 
617 aa  270  7e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0016  gamma-glutamyltransferase  36.14 
 
 
596 aa  265  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  33.73 
 
 
586 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  32.16 
 
 
582 aa  262  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  32.69 
 
 
583 aa  262  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  32.92 
 
 
580 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  33.22 
 
 
576 aa  261  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  32.46 
 
 
576 aa  261  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14390  gamma-glutamyltransferase 1  37.18 
 
 
612 aa  259  7e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220116  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  32.33 
 
 
590 aa  259  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  38.21 
 
 
590 aa  257  4e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  35.37 
 
 
576 aa  256  9e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  32.57 
 
 
599 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  34.42 
 
 
589 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  36.24 
 
 
586 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  33.57 
 
 
606 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  34.89 
 
 
580 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  35.4 
 
 
594 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  34.87 
 
 
581 aa  253  9.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  35.28 
 
 
577 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  34.89 
 
 
580 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  34.89 
 
 
580 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  31.39 
 
 
583 aa  251  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  35.07 
 
 
583 aa  250  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  35.88 
 
 
594 aa  250  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.437082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>