More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3535 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 596 aa  1199    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  61.57 
 
 		 623 aa  670    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  91.44 
 
 		 596 aa  1100    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  61.98 
 
 		 625 aa  722    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  65.01 
 
 		 610 aa  753    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  85.42 
 
 		 596 aa  1012    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  96.64 
 
 		 598 aa  1152    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  64.76 
 
 		 653 aa  759    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  56.42 
 
 		 625 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  56.85 
 
 		 624 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  56.6 
 
 		 626 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  56.67 
 
 		 624 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  56.67 
 
 		 626 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  56.85 
 
 		 624 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  55.9 
 
 		 648 aa  598  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  53.51 
 
 		 623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  53.09 
 
 		 599 aa  564  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  53.51 
 
 		 623 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  52.11 
 
 		 618 aa  537  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  53.66 
 
 		 628 aa  536  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  54.73 
 
 		 621 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  52.59 
 
 		 627 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  52.59 
 
 		 627 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  52.59 
 
 		 627 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  52.77 
 
 		 626 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  52.95 
 
 		 692 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  52.77 
 
 		 627 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  52.59 
 
 		 627 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  51.17 
 
 		 624 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  49.83 
 
 		 586 aa  516  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  52.77 
 
 		 629 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  48.63 
 
 		 586 aa  500  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  50.53 
 
 		 595 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  50.35 
 
 		 593 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  45.55 
 
 		 586 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  46.75 
 
 		 577 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  44.98 
 
 		 588 aa  473  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  47.03 
 
 		 580 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  47.7 
 
 		 643 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  46.05 
 
 		 669 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  43.71 
 
 		 588 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  46.23 
 
 		 662 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  44.58 
 
 		 588 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  50.09 
 
 		 596 aa  462  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  51.25 
 
 		 588 aa  465  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  45.85 
 
 		 634 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  45.85 
 
 		 634 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  45.85 
 
 		 634 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  44.15 
 
 		 581 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  45.65 
 
 		 662 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  45.57 
 
 		 662 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  47.66 
 
 		 648 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  45.51 
 
 		 661 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  44.5 
 
 		 658 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  45.35 
 
 		 661 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  45.35 
 
 		 661 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  45.11 
 
 		 691 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  45.44 
 
 		 660 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  46.08 
 
 		 652 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  46 
 
 		 595 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  45.57 
 
 		 616 aa  435  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  44.74 
 
 		 696 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  47.21 
 
 		 583 aa  428  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  45.24 
 
 		 575 aa  418  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  45.82 
 
 		 571 aa  413  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  44.06 
 
 		 572 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  44.42 
 
 		 619 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  39.61 
 
 		 582 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  47.6 
 
 		 437 aa  361  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  37.23 
 
 		 576 aa  342  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  38.39 
 
 		 578 aa  323  5e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  35.54 
 
 		 645 aa  299  9e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  40.71 
 
 		 590 aa  298  2e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  35.97 
 
 		 586 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  37.54 
 
 		 606 aa  297  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  35.18 
 
 		 645 aa  296  9e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  36.4 
 
 		 583 aa  295  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  38.56 
 
 		 586 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  37.65 
 
 		 589 aa  290  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  34.98 
 
 		 617 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  37.96 
 
 		 583 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  35.34 
 
 		 593 aa  286  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  35.4 
 
 		 580 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3208  gamma-glutamyltransferase  34.53 
 
 		 577 aa  286  7e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.295099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  35.23 
 
 		 581 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  35.22 
 
 		 580 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  35.22 
 
 		 580 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  35.51 
 
 		 577 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  36.77 
 
 		 576 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  34.97 
 
 		 581 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  35.04 
 
 		 580 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0016  gamma-glutamyltransferase  37.48 
 
 		 596 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  35.04 
 
 		 580 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  35.65 
 
 		 576 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  35.33 
 
 		 581 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  33.78 
 
 		 588 aa  281  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  34.31 
 
 		 580 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  34.63 
 
 		 581 aa  280  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  34.68 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  34.07 
 
 		 590 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>