More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1314 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  56.24 
 
 
660 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  62.2 
 
 
634 aa  744    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  58.35 
 
 
669 aa  666    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  57.96 
 
 
658 aa  690    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  54.48 
 
 
662 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  63.55 
 
 
648 aa  726    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  56.81 
 
 
662 aa  641    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  62.2 
 
 
634 aa  744    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  62.11 
 
 
643 aa  756    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  62.2 
 
 
634 aa  744    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
652 aa  1305    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  58.35 
 
 
691 aa  632  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  54.48 
 
 
662 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  56.15 
 
 
661 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  56.31 
 
 
661 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  56.31 
 
 
661 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  55.8 
 
 
696 aa  618  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  54.97 
 
 
616 aa  605  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  48.59 
 
 
625 aa  479  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  46.31 
 
 
653 aa  478  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  45.6 
 
 
610 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  45.04 
 
 
625 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  44.92 
 
 
624 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  44.92 
 
 
624 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  47.25 
 
 
648 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  47.24 
 
 
624 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  45.28 
 
 
624 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  45.92 
 
 
596 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  47.41 
 
 
626 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  47.16 
 
 
626 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  46.22 
 
 
596 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  45.99 
 
 
623 aa  449  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  46.08 
 
 
596 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  45.91 
 
 
598 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  45.83 
 
 
623 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  45.31 
 
 
618 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  46.51 
 
 
628 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  44.69 
 
 
586 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  43.3 
 
 
586 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  45.56 
 
 
595 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  45.25 
 
 
621 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  45.56 
 
 
593 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  45.79 
 
 
623 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  43.24 
 
 
599 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  41.82 
 
 
588 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  42.52 
 
 
588 aa  415  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  43.67 
 
 
577 aa  412  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  41.57 
 
 
581 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  45.47 
 
 
627 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  45.47 
 
 
627 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  45.89 
 
 
629 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  45.8 
 
 
627 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  45.8 
 
 
626 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  45.8 
 
 
692 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  40.54 
 
 
588 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  45.29 
 
 
627 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  45.29 
 
 
627 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  40.64 
 
 
586 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  43.44 
 
 
595 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  43.55 
 
 
588 aa  385  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  42.22 
 
 
596 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  40.98 
 
 
580 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  41.81 
 
 
619 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  42.86 
 
 
572 aa  372  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  43.54 
 
 
571 aa  361  3e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  39.72 
 
 
582 aa  348  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  41.35 
 
 
583 aa  347  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  41.28 
 
 
575 aa  341  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  43.19 
 
 
437 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  34.85 
 
 
576 aa  296  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3760  gamma-glutamyltransferase  39.22 
 
 
620 aa  279  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2007  gamma-glutamyltransferase  36.61 
 
 
613 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408979  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  36.93 
 
 
578 aa  273  8.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  39.5 
 
 
614 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 
581 aa  269  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  32.81 
 
 
576 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  33.57 
 
 
599 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  36.63 
 
 
579 aa  266  8.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  31.81 
 
 
617 aa  263  8e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  33.28 
 
 
583 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  37.94 
 
 
590 aa  260  5.0000000000000005e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  36.64 
 
 
601 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  38.48 
 
 
595 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  31.37 
 
 
582 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  36.81 
 
 
586 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  35.34 
 
 
576 aa  253  6e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  37.06 
 
 
583 aa  253  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  34.18 
 
 
587 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  35.41 
 
 
589 aa  253  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  35.12 
 
 
594 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  34.46 
 
 
578 aa  250  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  34.06 
 
 
588 aa  250  7e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  33.45 
 
 
645 aa  249  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  32.75 
 
 
580 aa  249  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  34.04 
 
 
577 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  32.99 
 
 
645 aa  247  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  35.33 
 
 
581 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  31.54 
 
 
583 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  31.94 
 
 
579 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1525  Gamma-glutamyltransferase  38.68 
 
 
596 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0104264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>