More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02192 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  100 
 
 		 580 aa  1191    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  52.5 
 
 		 586 aa  634  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  47.77 
 
 		 588 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  47.77 
 
 		 588 aa  531  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  50.78 
 
 		 586 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  50 
 
 		 593 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  49.65 
 
 		 595 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  47.4 
 
 		 588 aa  511  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  47.48 
 
 		 581 aa  509  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  47.44 
 
 		 586 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  47.53 
 
 		 577 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  46.13 
 
 		 596 aa  488  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  46.89 
 
 		 625 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  46.62 
 
 		 624 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  47.21 
 
 		 648 aa  485  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  47.29 
 
 		 625 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  46.45 
 
 		 624 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  46.98 
 
 		 626 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  46.97 
 
 		 626 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  46.45 
 
 		 624 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  47.03 
 
 		 596 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  46.27 
 
 		 624 aa  474  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  47.2 
 
 		 598 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  44.18 
 
 		 599 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  47.13 
 
 		 595 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  47.07 
 
 		 596 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  46.62 
 
 		 596 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  44.71 
 
 		 653 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  45.29 
 
 		 610 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  45.67 
 
 		 623 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  45.67 
 
 		 623 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  46.66 
 
 		 628 aa  438  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  46.32 
 
 		 621 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  43.02 
 
 		 669 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  45.05 
 
 		 588 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  43.65 
 
 		 618 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  44.47 
 
 		 571 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  41.93 
 
 		 662 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  42.56 
 
 		 623 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  42.91 
 
 		 583 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  42.18 
 
 		 627 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  42.36 
 
 		 627 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  42.18 
 
 		 627 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  41.04 
 
 		 658 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  42.36 
 
 		 627 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  42.36 
 
 		 692 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  42.36 
 
 		 627 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  42.36 
 
 		 626 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  41.56 
 
 		 696 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  41.1 
 
 		 575 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  40.83 
 
 		 634 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  40.83 
 
 		 634 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  40.83 
 
 		 634 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  43.33 
 
 		 572 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  39.5 
 
 		 643 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  41.24 
 
 		 648 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  41.46 
 
 		 629 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  47.49 
 
 		 437 aa  382  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  41.16 
 
 		 582 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  38.79 
 
 		 662 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  38.95 
 
 		 662 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  40.1 
 
 		 616 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  38.59 
 
 		 619 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  40.98 
 
 		 652 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  38.71 
 
 		 661 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  38.71 
 
 		 661 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  39.39 
 
 		 660 aa  365  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  38.55 
 
 		 661 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  38.71 
 
 		 691 aa  362  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  38.69 
 
 		 576 aa  360  5e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  36.26 
 
 		 580 aa  318  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  37.45 
 
 		 583 aa  309  8e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3633  gamma-glutamyltransferase  37.7 
 
 		 589 aa  305  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.117806 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  35.75 
 
 		 580 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  36.31 
 
 		 617 aa  301  3e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  34.53 
 
 		 581 aa  300  6e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  35.75 
 
 		 580 aa  299  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  35.57 
 
 		 580 aa  299  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  36.95 
 
 		 645 aa  299  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  35.57 
 
 		 580 aa  299  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  34.7 
 
 		 577 aa  298  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  35.39 
 
 		 580 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  35.39 
 
 		 580 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  35.46 
 
 		 581 aa  297  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  36.22 
 
 		 576 aa  296  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  35.39 
 
 		 580 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  35.39 
 
 		 580 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  35.79 
 
 		 645 aa  295  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  34.53 
 
 		 581 aa  295  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  35.87 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  35.98 
 
 		 606 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  35.05 
 
 		 599 aa  293  5e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  35.58 
 
 		 589 aa  293  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  35.62 
 
 		 586 aa  293  9e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  34.48 
 
 		 581 aa  292  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  35.03 
 
 		 580 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  35.68 
 
 		 586 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  37.48 
 
 		 583 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  35.69 
 
 		 587 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  35.03 
 
 		 580 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>