More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002088 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  58.72 
 
 		 596 aa  699    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  57.34 
 
 		 595 aa  683    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  57.17 
 
 		 593 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  90.29 
 
 		 588 aa  1112    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  62.55 
 
 		 595 aa  685    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  62.89 
 
 		 581 aa  753    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  73.64 
 
 		 588 aa  924    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  62.07 
 
 		 586 aa  756    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  57.79 
 
 		 586 aa  684    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  100 
 
 		 588 aa  1214    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  49.91 
 
 		 577 aa  561  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  50.27 
 
 		 586 aa  560  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  59.5 
 
 		 437 aa  539  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  47.77 
 
 		 580 aa  534  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  47.91 
 
 		 624 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  47.91 
 
 		 624 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  47.65 
 
 		 648 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  47.74 
 
 		 624 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  47.56 
 
 		 626 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  47.75 
 
 		 624 aa  508  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  47.39 
 
 		 625 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  46.61 
 
 		 626 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  45.67 
 
 		 625 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  45.08 
 
 		 610 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  43.88 
 
 		 598 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  43.71 
 
 		 596 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  43.97 
 
 		 653 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  42.45 
 
 		 596 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  44.23 
 
 		 596 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  45.14 
 
 		 623 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  45.14 
 
 		 623 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  46.44 
 
 		 571 aa  455  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  44.66 
 
 		 599 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  45.51 
 
 		 575 aa  451  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  44.41 
 
 		 618 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  42.48 
 
 		 669 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  43.33 
 
 		 588 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  43.15 
 
 		 623 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  43.77 
 
 		 627 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  43.77 
 
 		 692 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  45.75 
 
 		 628 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  44.03 
 
 		 583 aa  430  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  43.77 
 
 		 626 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  43.59 
 
 		 627 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  43.59 
 
 		 627 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  43.59 
 
 		 627 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  43.59 
 
 		 627 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  42.88 
 
 		 621 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  41.01 
 
 		 619 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  40.03 
 
 		 662 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  42.02 
 
 		 582 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  40.27 
 
 		 658 aa  411  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  41.58 
 
 		 629 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  41.82 
 
 		 652 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  41.69 
 
 		 648 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  40.31 
 
 		 643 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  39.57 
 
 		 634 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  39.57 
 
 		 634 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  39.57 
 
 		 634 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  41.52 
 
 		 696 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  40.4 
 
 		 662 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  40.23 
 
 		 660 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  41.62 
 
 		 572 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  40.23 
 
 		 662 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  40.07 
 
 		 691 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  37.21 
 
 		 576 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  39.8 
 
 		 661 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  39.97 
 
 		 661 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  39.97 
 
 		 661 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  38.08 
 
 		 616 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  37.41 
 
 		 645 aa  354  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  37.26 
 
 		 645 aa  352  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  36.2 
 
 		 599 aa  347  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  37.95 
 
 		 617 aa  343  5.999999999999999e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  37.55 
 
 		 586 aa  340  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  34.4 
 
 		 581 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  36.87 
 
 		 578 aa  339  8e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  36.12 
 
 		 576 aa  334  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  38.12 
 
 		 579 aa  332  9e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  36.59 
 
 		 583 aa  330  3e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  36.12 
 
 		 580 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  35.95 
 
 		 580 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  36.35 
 
 		 581 aa  327  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  34.66 
 
 		 582 aa  326  7e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  35.89 
 
 		 579 aa  324  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  35.99 
 
 		 581 aa  325  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  37.8 
 
 		 599 aa  324  3e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  35.74 
 
 		 583 aa  323  4e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  35.79 
 
 		 580 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  34.86 
 
 		 588 aa  323  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  35.79 
 
 		 580 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  35.79 
 
 		 580 aa  323  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  37.14 
 
 		 581 aa  321  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  35.99 
 
 		 581 aa  320  5e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  35.81 
 
 		 577 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  35.37 
 
 		 590 aa  317  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  36.25 
 
 		 580 aa  317  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  36.25 
 
 		 580 aa  317  5e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  37.7 
 
 		 556 aa  317  5e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  35.88 
 
 		 579 aa  316  8e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>