More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2892 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  68.67 
 
 
627 aa  778    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  56.58 
 
 
618 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  59 
 
 
625 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
624 aa  1266    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  68.85 
 
 
692 aa  780    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  95.68 
 
 
625 aa  1219    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  69.37 
 
 
629 aa  787    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  68.5 
 
 
627 aa  775    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  55.43 
 
 
623 aa  637    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  68.67 
 
 
627 aa  778    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  68.67 
 
 
627 aa  778    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  68.67 
 
 
626 aa  778    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  55.65 
 
 
653 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  90.71 
 
 
648 aa  1142    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  68.5 
 
 
627 aa  775    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  99.36 
 
 
624 aa  1260    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  55.43 
 
 
623 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  93.29 
 
 
626 aa  1176    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  93.45 
 
 
626 aa  1181    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  99.36 
 
 
624 aa  1260    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  58.58 
 
 
628 aa  623  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  54.12 
 
 
610 aa  618  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  56.38 
 
 
599 aa  618  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  55.03 
 
 
621 aa  615  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  56.67 
 
 
596 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  56.75 
 
 
598 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  56.14 
 
 
596 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  54.2 
 
 
596 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  55.63 
 
 
623 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  54.56 
 
 
624 aa  573  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  49.91 
 
 
588 aa  522  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  48.7 
 
 
586 aa  525  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  47.74 
 
 
588 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  47.91 
 
 
588 aa  511  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  49.48 
 
 
586 aa  508  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  50.62 
 
 
595 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  47.13 
 
 
581 aa  504  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  50.44 
 
 
593 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  49.51 
 
 
669 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  46.1 
 
 
586 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  48.76 
 
 
662 aa  490  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  50.36 
 
 
596 aa  486  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  46.62 
 
 
580 aa  486  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  50.09 
 
 
588 aa  487  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  48.38 
 
 
577 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  47.52 
 
 
634 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  47.52 
 
 
634 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  47.52 
 
 
634 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  48.24 
 
 
643 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  47.14 
 
 
658 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  47.93 
 
 
696 aa  461  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  46.4 
 
 
662 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  46.55 
 
 
662 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  47.91 
 
 
691 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  47.77 
 
 
595 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  47.75 
 
 
661 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  47.75 
 
 
661 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  44.92 
 
 
652 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  47.58 
 
 
661 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  45.96 
 
 
648 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  46.91 
 
 
660 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  45.8 
 
 
616 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  45.41 
 
 
583 aa  418  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  46.31 
 
 
575 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  47.37 
 
 
571 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  44.14 
 
 
572 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  40.53 
 
 
582 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  46.84 
 
 
437 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  41.7 
 
 
619 aa  364  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  36.06 
 
 
576 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  36.67 
 
 
578 aa  292  1e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  36.23 
 
 
586 aa  290  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  37.85 
 
 
595 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  36.4 
 
 
589 aa  274  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  34.95 
 
 
580 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  35.42 
 
 
581 aa  270  5.9999999999999995e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  32.04 
 
 
588 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  39.69 
 
 
601 aa  270  8e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  37.19 
 
 
587 aa  270  8e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  34.73 
 
 
617 aa  269  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  33.69 
 
 
576 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  34.95 
 
 
580 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  34.95 
 
 
580 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  34.4 
 
 
580 aa  267  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 
581 aa  267  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  35.06 
 
 
577 aa  266  7e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  34.7 
 
 
580 aa  266  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  34.88 
 
 
580 aa  266  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00590  gamma-glutamyltranspeptidase  34.86 
 
 
576 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  34.88 
 
 
580 aa  266  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  34.77 
 
 
580 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  34.95 
 
 
580 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  34.7 
 
 
581 aa  265  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0368944 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  34.7 
 
 
580 aa  264  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  34.7 
 
 
580 aa  264  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  33.51 
 
 
599 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  34.53 
 
 
581 aa  263  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  34.46 
 
 
606 aa  263  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5929  gamma-glutamyltransferase  36.18 
 
 
628 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  34.93 
 
 
645 aa  262  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>