More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2655 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 619 aa  1223    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  57.14 
 
 		 575 aa  610  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  56.86 
 
 		 583 aa  549  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  49.01 
 
 		 586 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  48.54 
 
 		 593 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  48.72 
 
 		 595 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  44.14 
 
 		 581 aa  448  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  42.78 
 
 		 586 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  46.65 
 
 		 596 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  43.04 
 
 		 588 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  43.54 
 
 		 577 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  41.24 
 
 		 586 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  41.94 
 
 		 588 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  41.21 
 
 		 588 aa  422  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  44.39 
 
 		 598 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  45.42 
 
 		 595 aa  411  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  43.07 
 
 		 653 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  44.21 
 
 		 596 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  44.91 
 
 		 596 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  43.5 
 
 		 624 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  44.31 
 
 		 596 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  44.42 
 
 		 599 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  43.35 
 
 		 610 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  43.32 
 
 		 623 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  44.02 
 
 		 572 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  43.15 
 
 		 623 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  43.78 
 
 		 571 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  42.76 
 
 		 648 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  43.27 
 
 		 618 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  38.84 
 
 		 580 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  39.96 
 
 		 625 aa  382  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  44.86 
 
 		 588 aa  382  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  43.72 
 
 		 621 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  42.05 
 
 		 624 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  41.68 
 
 		 652 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  41.83 
 
 		 626 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  42.05 
 
 		 624 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  41.87 
 
 		 624 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  41.52 
 
 		 625 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  41.3 
 
 		 626 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  41.51 
 
 		 634 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  41.51 
 
 		 634 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  41.51 
 
 		 634 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  43.22 
 
 		 629 aa  363  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  43.3 
 
 		 628 aa  362  9e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  42.68 
 
 		 627 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  42.68 
 
 		 627 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  40.34 
 
 		 643 aa  360  5e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  42.68 
 
 		 627 aa  360  6e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  42.68 
 
 		 627 aa  360  6e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  38.66 
 
 		 582 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  42.68 
 
 		 626 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  42.68 
 
 		 627 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  42.68 
 
 		 692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  42.45 
 
 		 623 aa  356  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  39.9 
 
 		 662 aa  351  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  43.39 
 
 		 586 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  42.23 
 
 		 648 aa  346  8.999999999999999e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  40.37 
 
 		 669 aa  345  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  45.09 
 
 		 437 aa  345  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  40.51 
 
 		 696 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  39.29 
 
 		 658 aa  337  5e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  40.47 
 
 		 662 aa  333  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  40.64 
 
 		 662 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  40.26 
 
 		 587 aa  330  6e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  40.2 
 
 		 691 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  37.1 
 
 		 576 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  36.8 
 
 		 581 aa  327  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  40.37 
 
 		 661 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  41.43 
 
 		 583 aa  325  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  40.2 
 
 		 661 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  40.2 
 
 		 661 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  37.82 
 
 		 599 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  40.03 
 
 		 660 aa  320  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  39.2 
 
 		 578 aa  317  5e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  38.06 
 
 		 606 aa  316  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  36.27 
 
 		 580 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  36.44 
 
 		 580 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  36.44 
 
 		 580 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  38.2 
 
 		 583 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  36.44 
 
 		 580 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  36.86 
 
 		 582 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  36.67 
 
 		 580 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  36.17 
 
 		 581 aa  312  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  36.67 
 
 		 580 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  36.85 
 
 		 580 aa  311  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  37.03 
 
 		 581 aa  311  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  36.67 
 
 		 580 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  36.22 
 
 		 581 aa  311  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  36.67 
 
 		 580 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  36 
 
 		 581 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  40.86 
 
 		 590 aa  309  9e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  37.32 
 
 		 580 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  35.97 
 
 		 577 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  39.18 
 
 		 616 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  36.11 
 
 		 580 aa  308  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  39.08 
 
 		 610 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  33.39 
 
 		 576 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2090  gamma-glutamyltransferase  38.96 
 
 		 606 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.184106  normal  0.0259865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  37.65 
 
 		 579 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>