More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1559 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  59.75 
 
 
578 aa  645    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
590 aa  1161    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  37.95 
 
 
588 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  39.82 
 
 
586 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  40.59 
 
 
598 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  36.91 
 
 
581 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  40.71 
 
 
596 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  36.62 
 
 
586 aa  343  7e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  36.67 
 
 
588 aa  342  8e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  40.54 
 
 
596 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  40.15 
 
 
593 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  36.61 
 
 
588 aa  340  5e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  41.04 
 
 
619 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  39.96 
 
 
595 aa  336  9e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  40.18 
 
 
596 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  41.83 
 
 
588 aa  330  6e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  37.18 
 
 
586 aa  329  8e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  37.25 
 
 
577 aa  329  9e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  40.29 
 
 
596 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  39.39 
 
 
653 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  38.83 
 
 
625 aa  324  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  39.3 
 
 
595 aa  322  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  38.35 
 
 
599 aa  322  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  38.45 
 
 
623 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  38.51 
 
 
618 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  38.28 
 
 
623 aa  320  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  37.13 
 
 
610 aa  320  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  39.67 
 
 
571 aa  318  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  38.87 
 
 
628 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  36.22 
 
 
624 aa  313  5.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  38.5 
 
 
583 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  33.45 
 
 
580 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  37.3 
 
 
572 aa  306  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  34.54 
 
 
582 aa  303  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  36.33 
 
 
658 aa  300  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  38.45 
 
 
634 aa  300  7e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  38.45 
 
 
634 aa  300  7e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  38.45 
 
 
634 aa  300  7e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  38.01 
 
 
621 aa  299  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  37.1 
 
 
669 aa  298  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  37.72 
 
 
652 aa  294  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  37.52 
 
 
662 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  39.6 
 
 
623 aa  293  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  36.46 
 
 
648 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  36.57 
 
 
626 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  36.11 
 
 
624 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  36.11 
 
 
624 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  36.11 
 
 
624 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  36.11 
 
 
625 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  36.4 
 
 
626 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  36.12 
 
 
575 aa  283  5.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  37.38 
 
 
627 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  37.38 
 
 
627 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  37.38 
 
 
692 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  37.38 
 
 
627 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  37.38 
 
 
626 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  35.86 
 
 
696 aa  273  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  35.8 
 
 
643 aa  272  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  37.2 
 
 
627 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  36.9 
 
 
629 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  37.2 
 
 
627 aa  272  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  35.8 
 
 
648 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  35.29 
 
 
661 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  35.29 
 
 
661 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  35.29 
 
 
661 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  35.29 
 
 
691 aa  262  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  35.34 
 
 
662 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  35.17 
 
 
662 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  35.12 
 
 
660 aa  256  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  35.94 
 
 
616 aa  250  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  29.17 
 
 
576 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  39.19 
 
 
437 aa  248  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  36.7 
 
 
601 aa  246  6.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  33.69 
 
 
579 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  33.44 
 
 
589 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  32.29 
 
 
581 aa  233  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  30.68 
 
 
581 aa  233  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  30.24 
 
 
577 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  30.68 
 
 
581 aa  233  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  30.68 
 
 
580 aa  233  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  30.91 
 
 
583 aa  233  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  30.68 
 
 
580 aa  233  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  30.68 
 
 
580 aa  232  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  30.68 
 
 
580 aa  232  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  30.68 
 
 
580 aa  232  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  30.31 
 
 
580 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  30.31 
 
 
580 aa  231  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  30.5 
 
 
581 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  34.72 
 
 
614 aa  230  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  35.8 
 
 
595 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  30.31 
 
 
580 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  31.77 
 
 
571 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00590  gamma-glutamyltranspeptidase  30.56 
 
 
576 aa  226  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  30.13 
 
 
580 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  30.13 
 
 
580 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  32.24 
 
 
606 aa  223  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  32.84 
 
 
599 aa  220  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  31.16 
 
 
619 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  31.74 
 
 
593 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5929  gamma-glutamyltransferase  33.66 
 
 
628 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>