More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4005 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  58.39 
 
 		 588 aa  693    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  58.81 
 
 		 588 aa  689    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  57.5 
 
 		 588 aa  687    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  98.99 
 
 		 595 aa  1154    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  68.8 
 
 		 596 aa  785    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  70.3 
 
 		 595 aa  756    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  59.15 
 
 		 581 aa  691    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  62.56 
 
 		 586 aa  692    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  58.74 
 
 		 586 aa  686    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 593 aa  1165    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  71.33 
 
 		 437 aa  625  1e-178  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  49.16 
 
 		 580 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  50.8 
 
 		 648 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  51.7 
 
 		 626 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  48.15 
 
 		 586 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  50.44 
 
 		 624 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  50.62 
 
 		 626 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  50.44 
 
 		 624 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  50.44 
 
 		 624 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  49.31 
 
 		 625 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  49.91 
 
 		 625 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  50.88 
 
 		 598 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  50.28 
 
 		 577 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  48.58 
 
 		 653 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  50.35 
 
 		 596 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  50.53 
 
 		 596 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  50.71 
 
 		 596 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  50.35 
 
 		 610 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  50.71 
 
 		 624 aa  481  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  49.91 
 
 		 575 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  48.85 
 
 		 599 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  51.03 
 
 		 571 aa  458  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  47.99 
 
 		 623 aa  451  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  47.99 
 
 		 623 aa  450  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  47.08 
 
 		 623 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  48.69 
 
 		 619 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  46.95 
 
 		 618 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  48.73 
 
 		 588 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  47.4 
 
 		 572 aa  438  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  48.72 
 
 		 583 aa  435  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  45.3 
 
 		 669 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  43.99 
 
 		 658 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  44.01 
 
 		 652 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  46.35 
 
 		 627 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  46.35 
 
 		 627 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  46.18 
 
 		 627 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  46.18 
 
 		 627 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  46.18 
 
 		 692 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  46.18 
 
 		 626 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  46.18 
 
 		 627 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  43.69 
 
 		 662 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  45.71 
 
 		 629 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  46.58 
 
 		 621 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  44.98 
 
 		 634 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  44.98 
 
 		 634 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  44.98 
 
 		 634 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  43.27 
 
 		 582 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  43.3 
 
 		 643 aa  388  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  46.14 
 
 		 628 aa  382  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  42.64 
 
 		 662 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  43 
 
 		 691 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  45.57 
 
 		 648 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  42.95 
 
 		 616 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  42.66 
 
 		 662 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  43.34 
 
 		 660 aa  379  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  42.47 
 
 		 661 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  42.64 
 
 		 661 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  42.64 
 
 		 661 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  41.64 
 
 		 696 aa  362  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  36.63 
 
 		 576 aa  352  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  39.58 
 
 		 589 aa  339  9e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14390  gamma-glutamyltransferase 1  45.98 
 
 		 612 aa  337  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2007  gamma-glutamyltransferase  42.77 
 
 		 613 aa  326  6e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3760  gamma-glutamyltransferase  44.31 
 
 		 620 aa  325  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  38.75 
 
 		 580 aa  325  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  39.27 
 
 		 587 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  38.08 
 
 		 599 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  35.45 
 
 		 590 aa  319  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  39.2 
 
 		 578 aa  317  3e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  36.3 
 
 		 576 aa  316  7e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  41.58 
 
 		 601 aa  316  9e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  37.12 
 
 		 578 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  43.69 
 
 		 595 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  35.06 
 
 		 582 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  42.38 
 
 		 579 aa  313  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  41.61 
 
 		 614 aa  312  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2332  gamma-glutamyltransferase  45.66 
 
 		 602 aa  311  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167584  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  38.31 
 
 		 581 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  37.39 
 
 		 586 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  34.9 
 
 		 581 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0194  gamma-glutamyltransferase  35.37 
 
 		 668 aa  310  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0200  gamma-glutamyltransferase  35.37 
 
 		 668 aa  310  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  37.3 
 
 		 578 aa  310  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  36.79 
 
 		 606 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  40.97 
 
 		 610 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5232  gamma-glutamyltransferase  41.98 
 
 		 605 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  39.2 
 
 		 590 aa  307  3e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  36.25 
 
 		 583 aa  307  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  34.9 
 
 		 599 aa  306  7e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2446  gamma-glutamyltransferase  42.21 
 
 		 624 aa  306  9.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605656  normal  0.196083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>