More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2446 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2611  gamma-glutamyltransferase  87.44 
 
 		 646 aa  1021    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2446  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 624 aa  1232    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605656  normal  0.196083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2007  gamma-glutamyltransferase  55.16 
 
 		 613 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3760  gamma-glutamyltransferase  55.22 
 
 		 620 aa  567  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5929  gamma-glutamyltransferase  54.61 
 
 		 628 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  56.03 
 
 		 595 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1525  Gamma-glutamyltransferase  53.96 
 
 		 596 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0104264 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  53.98 
 
 		 614 aa  529  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2332  gamma-glutamyltransferase  57.64 
 
 		 602 aa  528  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167584  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14390  gamma-glutamyltransferase 1  52.55 
 
 		 612 aa  525  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5232  gamma-glutamyltransferase  55.82 
 
 		 605 aa  525  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  49.47 
 
 		 579 aa  459  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  38.01 
 
 		 588 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  42.21 
 
 		 595 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  42.01 
 
 		 593 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  38.26 
 
 		 588 aa  307  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  38.66 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  39.92 
 
 		 589 aa  301  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  40.58 
 
 		 601 aa  300  8e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  35.39 
 
 		 581 aa  299  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  36.88 
 
 		 590 aa  293  7e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  36.28 
 
 		 556 aa  293  8e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  36.1 
 
 		 556 aa  292  2e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  36.85 
 
 		 579 aa  290  6e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  40.33 
 
 		 595 aa  289  8e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  39.11 
 
 		 596 aa  289  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  37.13 
 
 		 576 aa  288  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  34.01 
 
 		 581 aa  288  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  38.29 
 
 		 619 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  37.13 
 
 		 581 aa  287  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  39.02 
 
 		 586 aa  286  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  36.71 
 
 		 586 aa  286  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  36.11 
 
 		 599 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  37.38 
 
 		 577 aa  284  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  36.73 
 
 		 583 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  35.4 
 
 		 586 aa  283  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  37.12 
 
 		 580 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  39.17 
 
 		 606 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  37.87 
 
 		 580 aa  281  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  37.87 
 
 		 580 aa  281  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  37.87 
 
 		 580 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  37.87 
 
 		 580 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  36.76 
 
 		 580 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  35.88 
 
 		 582 aa  280  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  37.67 
 
 		 580 aa  280  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  38.89 
 
 		 576 aa  280  7e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  37.43 
 
 		 581 aa  279  9e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  37.67 
 
 		 581 aa  279  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  36.76 
 
 		 580 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  37.88 
 
 		 589 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  37.48 
 
 		 577 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  36.58 
 
 		 580 aa  277  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  36.76 
 
 		 579 aa  276  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  35.3 
 
 		 617 aa  276  7e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  36.58 
 
 		 580 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  37.43 
 
 		 581 aa  276  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  36.2 
 
 		 645 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  36.56 
 
 		 587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  35.66 
 
 		 579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  35.66 
 
 		 579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  35.66 
 
 		 579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  35.79 
 
 		 583 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  36.24 
 
 		 579 aa  273  7e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  36.82 
 
 		 579 aa  273  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  36.24 
 
 		 579 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  36.24 
 
 		 579 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  37.75 
 
 		 578 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  35.8 
 
 		 645 aa  272  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  32.97 
 
 		 580 aa  272  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  36.04 
 
 		 579 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  38.3 
 
 		 624 aa  270  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  36.98 
 
 		 653 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  36.33 
 
 		 577 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  33.85 
 
 		 586 aa  266  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  37.12 
 
 		 610 aa  266  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  36.45 
 
 		 576 aa  266  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  39.44 
 
 		 586 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  36.63 
 
 		 580 aa  265  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  34.4 
 
 		 599 aa  264  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  37.77 
 
 		 584 aa  262  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  33.8 
 
 		 604 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  34.16 
 
 		 626 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2090  gamma-glutamyltransferase  36 
 
 		 606 aa  261  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.184106  normal  0.0259865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  34.36 
 
 		 625 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  39.11 
 
 		 575 aa  260  7e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  34.27 
 
 		 624 aa  260  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  36.75 
 
 		 588 aa  259  7e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  34.27 
 
 		 624 aa  260  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  34.45 
 
 		 626 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  36.36 
 
 		 576 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  35.79 
 
 		 623 aa  259  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  36.36 
 
 		 576 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  36.18 
 
 		 594 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1754  gamma-glutamyltransferase  36.08 
 
 		 633 aa  259  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  35.4 
 
 		 648 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  36.89 
 
 		 586 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  36.22 
 
 		 581 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  34.28 
 
 		 624 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  35.62 
 
 		 623 aa  256  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  36.26 
 
 		 594 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>