More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4553 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0016  gamma-glutamyltransferase  61.09 
 
 		 596 aa  637    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 586 aa  1138    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  54.98 
 
 		 582 aa  635    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  88.07 
 
 		 583 aa  955    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1754  gamma-glutamyltransferase  74.24 
 
 		 633 aa  791    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2090  gamma-glutamyltransferase  73.53 
 
 		 606 aa  787    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.184106  normal  0.0259865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  74.74 
 
 		 610 aa  818    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  57.12 
 
 		 645 aa  628  1e-179  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  56.93 
 
 		 645 aa  628  1e-178  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  53.9 
 
 		 581 aa  625  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  56.55 
 
 		 579 aa  624  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  58.43 
 
 		 577 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  54.59 
 
 		 590 aa  623  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  56.75 
 
 		 617 aa  623  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  56.91 
 
 		 583 aa  621  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  58.8 
 
 		 580 aa  620  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  56.36 
 
 		 599 aa  619  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  56.91 
 
 		 579 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  56.73 
 
 		 579 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  60.15 
 
 		 594 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  56.55 
 
 		 579 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  56.73 
 
 		 579 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  54.7 
 
 		 579 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  56.91 
 
 		 579 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  56.91 
 
 		 579 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  56.55 
 
 		 579 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  60.75 
 
 		 594 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  60.93 
 
 		 589 aa  611  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  56.91 
 
 		 576 aa  609  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  58.26 
 
 		 576 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3633  gamma-glutamyltransferase  62.09 
 
 		 589 aa  605  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.117806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  55.52 
 
 		 589 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  52.91 
 
 		 581 aa  598  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  56.12 
 
 		 581 aa  598  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  56.72 
 
 		 581 aa  601  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  53.08 
 
 		 581 aa  601  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  53.42 
 
 		 577 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  56 
 
 		 583 aa  599  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  53.08 
 
 		 580 aa  595  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  53.08 
 
 		 580 aa  596  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  58.01 
 
 		 584 aa  597  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  53.08 
 
 		 580 aa  596  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  52.91 
 
 		 580 aa  594  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  53.42 
 
 		 580 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  55.74 
 
 		 606 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  53.6 
 
 		 580 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  52.91 
 
 		 580 aa  594  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  53.42 
 
 		 580 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  58.03 
 
 		 586 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  53.25 
 
 		 580 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  53.08 
 
 		 580 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  53.56 
 
 		 581 aa  582  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  53.2 
 
 		 576 aa  570  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  54.03 
 
 		 586 aa  551  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  51.69 
 
 		 619 aa  544  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  46.42 
 
 		 556 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  46.6 
 
 		 556 aa  495  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  52.29 
 
 		 587 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  52.48 
 
 		 578 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  51.75 
 
 		 586 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  50.1 
 
 		 583 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  48.38 
 
 		 579 aa  482  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  51.29 
 
 		 578 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  50.38 
 
 		 583 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  50.38 
 
 		 583 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  48.85 
 
 		 587 aa  481  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  50.19 
 
 		 583 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  49.28 
 
 		 578 aa  482  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  46.49 
 
 		 599 aa  478  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  50.18 
 
 		 574 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  49.3 
 
 		 579 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  48.33 
 
 		 592 aa  475  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  48.14 
 
 		 583 aa  474  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  49.33 
 
 		 583 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  51 
 
 		 588 aa  472  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  48.3 
 
 		 578 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  48.19 
 
 		 597 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  48.23 
 
 		 587 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  49.33 
 
 		 583 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  48.37 
 
 		 587 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  46.64 
 
 		 575 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  47.05 
 
 		 576 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  47.01 
 
 		 575 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  46.67 
 
 		 575 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  47.05 
 
 		 576 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  48.18 
 
 		 587 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  47.62 
 
 		 587 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  45.54 
 
 		 604 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0909  gamma-glutamyltransferase 1  44.5 
 
 		 590 aa  433  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.591211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  43.83 
 
 		 593 aa  432  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1522  gamma-glutamyltransferase  50.99 
 
 		 589 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5927  gamma-glutamyltransferase  46.91 
 
 		 566 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.779153  normal  0.531425 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4900  gamma-glutamyltransferase  47.63 
 
 		 617 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608373  normal  0.737431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4047  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  44.81 
 
 		 557 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46960  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  44.63 
 
 		 557 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199873  normal  0.0147072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2484  gamma-glutamyltransferase  44.84 
 
 		 557 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4654  gamma-glutamyltransferase  44.01 
 
 		 555 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4659  gamma-glutamyltransferase  44.09 
 
 		 555 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4521  gamma-glutamyltransferase  43.9 
 
 		 555 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229347  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3336  gamma-glutamyltransferase  43.76 
 
 		 573 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>