More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1005 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  61.72 
 
 
596 aa  722    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  69.5 
 
 
623 aa  825    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  58.48 
 
 
648 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  57.64 
 
 
624 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  100 
 
 
625 aa  1270    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  57.02 
 
 
626 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  68.67 
 
 
610 aa  811    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  56.18 
 
 
625 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  61.81 
 
 
596 aa  714    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  74.09 
 
 
653 aa  965    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  61.55 
 
 
598 aa  720    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  57.23 
 
 
624 aa  668    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  61.21 
 
 
596 aa  712    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  57.24 
 
 
626 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  57.23 
 
 
624 aa  668    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  52.33 
 
 
623 aa  578  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  52.49 
 
 
623 aa  580  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  49.11 
 
 
599 aa  568  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  49.69 
 
 
624 aa  564  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  54.37 
 
 
692 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  54.72 
 
 
629 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  54.37 
 
 
627 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  54.37 
 
 
627 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  54.19 
 
 
627 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  54.19 
 
 
626 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  54.19 
 
 
627 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  54.19 
 
 
627 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  52.79 
 
 
628 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  50.73 
 
 
618 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  52.93 
 
 
621 aa  548  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  49.23 
 
 
593 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  47.92 
 
 
586 aa  495  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  49.06 
 
 
595 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  48.12 
 
 
669 aa  498  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  47.14 
 
 
588 aa  495  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  48.88 
 
 
586 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  46.26 
 
 
662 aa  492  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  46.89 
 
 
580 aa  486  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  46.8 
 
 
586 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  46.88 
 
 
643 aa  484  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  45.67 
 
 
588 aa  485  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  45.95 
 
 
581 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  46.77 
 
 
577 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  44.98 
 
 
588 aa  478  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  45.61 
 
 
634 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  45.61 
 
 
634 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  45.61 
 
 
634 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  45.66 
 
 
658 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  46.87 
 
 
652 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  48.58 
 
 
596 aa  464  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  47.24 
 
 
661 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  47.24 
 
 
661 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  44.95 
 
 
662 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  47.08 
 
 
691 aa  458  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  45.55 
 
 
648 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  47.68 
 
 
588 aa  458  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  47.08 
 
 
661 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  46.6 
 
 
660 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  44.71 
 
 
662 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  46.84 
 
 
696 aa  452  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  45.58 
 
 
595 aa  430  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  44.35 
 
 
616 aa  432  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  45.83 
 
 
571 aa  431  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  44.9 
 
 
572 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  44.46 
 
 
575 aa  411  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  44.17 
 
 
583 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  42.46 
 
 
582 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  39.75 
 
 
619 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  45.89 
 
 
437 aa  363  6e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  36.95 
 
 
576 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  37.59 
 
 
578 aa  306  9.000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  35.7 
 
 
580 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  35.7 
 
 
580 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  38.65 
 
 
590 aa  285  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  35.36 
 
 
580 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0138  gamma-glutamyltransferase  36.52 
 
 
570 aa  281  4e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  35.19 
 
 
580 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  35.19 
 
 
580 aa  280  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  34.85 
 
 
586 aa  276  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  34.69 
 
 
581 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  34.93 
 
 
577 aa  275  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  34.01 
 
 
581 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  36.33 
 
 
579 aa  274  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  35.11 
 
 
581 aa  273  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  34.86 
 
 
580 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  34.86 
 
 
580 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  34.68 
 
 
580 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  33.94 
 
 
645 aa  271  2e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  35.67 
 
 
589 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  33.92 
 
 
645 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  34.68 
 
 
580 aa  270  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  34.68 
 
 
580 aa  270  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  34.8 
 
 
610 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  34.21 
 
 
580 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  32.63 
 
 
571 aa  266  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  34.97 
 
 
614 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  32.88 
 
 
593 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  32.82 
 
 
588 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  32.39 
 
 
582 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  35.39 
 
 
583 aa  261  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>