More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12422 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  55.18 
 
 
658 aa  701    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  70.54 
 
 
648 aa  821    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  69.87 
 
 
634 aa  863    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  62.11 
 
 
652 aa  750    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  56.83 
 
 
691 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  55.87 
 
 
661 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  57.89 
 
 
696 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  100 
 
 
643 aa  1293    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  59.36 
 
 
669 aa  680    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  55.87 
 
 
661 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  69.87 
 
 
634 aa  863    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  53.96 
 
 
662 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  69.87 
 
 
634 aa  863    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  53.58 
 
 
660 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  54.12 
 
 
662 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  57.41 
 
 
662 aa  661    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  55.71 
 
 
661 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  55.67 
 
 
616 aa  610  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  47.96 
 
 
653 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  48.59 
 
 
625 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  48.77 
 
 
610 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  48.59 
 
 
598 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  48.57 
 
 
624 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  48.57 
 
 
624 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  47.7 
 
 
596 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  47.17 
 
 
625 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  48.57 
 
 
648 aa  485  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  48.24 
 
 
624 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  48.83 
 
 
596 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  48.01 
 
 
626 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  47.1 
 
 
623 aa  477  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  48.09 
 
 
626 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  47.1 
 
 
623 aa  477  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  48.24 
 
 
596 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  45.79 
 
 
618 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  47.57 
 
 
628 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  44.12 
 
 
624 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  44.76 
 
 
599 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  45 
 
 
621 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  46.2 
 
 
623 aa  438  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  47.33 
 
 
626 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  47.33 
 
 
627 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  47.15 
 
 
627 aa  435  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  47.15 
 
 
627 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  47.69 
 
 
692 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  47.15 
 
 
627 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  47.15 
 
 
627 aa  435  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  47.42 
 
 
629 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  43.49 
 
 
586 aa  428  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  39.97 
 
 
586 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  39.83 
 
 
588 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  42.23 
 
 
577 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  40.31 
 
 
588 aa  415  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  40.37 
 
 
581 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  40.41 
 
 
586 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  40.03 
 
 
588 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  43.3 
 
 
595 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  43.3 
 
 
593 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  43.58 
 
 
596 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  39.5 
 
 
580 aa  399  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  43.93 
 
 
571 aa  383  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  44.05 
 
 
588 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  43.83 
 
 
583 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  42.46 
 
 
595 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  41.4 
 
 
575 aa  371  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  40.54 
 
 
619 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  40.46 
 
 
572 aa  362  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  38.99 
 
 
582 aa  355  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  41.19 
 
 
437 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  32.16 
 
 
617 aa  288  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  37.37 
 
 
586 aa  287  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  34.21 
 
 
645 aa  282  1e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  34.04 
 
 
645 aa  282  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  32.75 
 
 
583 aa  281  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  33.27 
 
 
576 aa  273  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  35.09 
 
 
576 aa  272  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  36.88 
 
 
578 aa  266  5.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  37.5 
 
 
601 aa  265  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  37.24 
 
 
583 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  32.65 
 
 
589 aa  263  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  31.53 
 
 
590 aa  263  6e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  33.16 
 
 
580 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  31.41 
 
 
576 aa  260  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  31.69 
 
 
581 aa  259  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  32.99 
 
 
580 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  32.99 
 
 
580 aa  258  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  32.99 
 
 
556 aa  258  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  37.88 
 
 
614 aa  258  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  36.46 
 
 
586 aa  257  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  35.7 
 
 
594 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  31.87 
 
 
579 aa  256  9e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  34.78 
 
 
577 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  31.17 
 
 
583 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  32.82 
 
 
580 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  32.47 
 
 
556 aa  254  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  34.34 
 
 
581 aa  254  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  33.1 
 
 
581 aa  254  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  32.82 
 
 
577 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5232  gamma-glutamyltransferase  37.5 
 
 
605 aa  253  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  31.79 
 
 
599 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>