More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3054 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  85.42 
 
 		 596 aa  1012    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  61.22 
 
 		 623 aa  669    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 596 aa  1196    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  61.81 
 
 		 625 aa  715    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  63.73 
 
 		 610 aa  739    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  85.4 
 
 		 598 aa  1019    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  63.99 
 
 		 653 aa  753    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  84.73 
 
 		 596 aa  1015    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  55.9 
 
 		 625 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  56.14 
 
 		 624 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  56.14 
 
 		 624 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  56.24 
 
 		 626 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  56.14 
 
 		 624 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  56.07 
 
 		 626 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  55.61 
 
 		 648 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  54.03 
 
 		 623 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  54.03 
 
 		 623 aa  560  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  52.75 
 
 		 599 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  53.22 
 
 		 618 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  54.59 
 
 		 628 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  54.31 
 
 		 621 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  52.95 
 
 		 627 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  52.77 
 
 		 627 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  52.77 
 
 		 627 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  52.77 
 
 		 692 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  52.95 
 
 		 627 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  48.72 
 
 		 586 aa  516  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  52.59 
 
 		 626 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  52.59 
 
 		 627 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  50.52 
 
 		 586 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  52.59 
 
 		 629 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  50.25 
 
 		 624 aa  504  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  50.53 
 
 		 593 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  50.71 
 
 		 595 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  46.88 
 
 		 669 aa  478  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  47.07 
 
 		 580 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  48.83 
 
 		 643 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  46.33 
 
 		 586 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  46.14 
 
 		 577 aa  465  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  45.38 
 
 		 588 aa  463  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  44.63 
 
 		 588 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  49.29 
 
 		 596 aa  457  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  45.57 
 
 		 662 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  44.89 
 
 		 658 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  44.23 
 
 		 588 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  50.9 
 
 		 588 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  46.7 
 
 		 634 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  46.7 
 
 		 634 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  46.7 
 
 		 634 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  44.06 
 
 		 581 aa  451  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  47.82 
 
 		 648 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  45.92 
 
 		 652 aa  445  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  43.59 
 
 		 691 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  43.99 
 
 		 662 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  43.92 
 
 		 662 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  43.81 
 
 		 661 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  44.88 
 
 		 696 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  43.65 
 
 		 661 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  43.65 
 
 		 661 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  45.74 
 
 		 616 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  46.36 
 
 		 595 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  43.9 
 
 		 660 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  46.93 
 
 		 583 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  44.62 
 
 		 575 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  45.55 
 
 		 571 aa  401  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  43.53 
 
 		 572 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  44.52 
 
 		 619 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  40.85 
 
 		 582 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  47.38 
 
 		 437 aa  352  8.999999999999999e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  36.02 
 
 		 576 aa  330  5.0000000000000004e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  37.34 
 
 		 578 aa  317  5e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  37.37 
 
 		 586 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  35.82 
 
 		 645 aa  304  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  39.23 
 
 		 586 aa  299  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  37.21 
 
 		 580 aa  298  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  37.01 
 
 		 581 aa  298  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  35.46 
 
 		 645 aa  298  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  37.04 
 
 		 580 aa  296  8e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  37.32 
 
 		 577 aa  296  8e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  37.04 
 
 		 580 aa  296  8e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  37.43 
 
 		 581 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  36.23 
 
 		 583 aa  295  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  36.86 
 
 		 580 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  36.86 
 
 		 580 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  36.97 
 
 		 580 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  36.78 
 
 		 606 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  40.18 
 
 		 590 aa  290  4e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  35.34 
 
 		 581 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  37.59 
 
 		 589 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  35.69 
 
 		 599 aa  290  7e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  38.56 
 
 		 583 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  36.8 
 
 		 580 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  36.8 
 
 		 580 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0016  gamma-glutamyltransferase  37.75 
 
 		 596 aa  288  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  34.33 
 
 		 617 aa  288  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  36.62 
 
 		 580 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  36.62 
 
 		 580 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  34.98 
 
 		 579 aa  286  8e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  36.09 
 
 		 581 aa  286  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  36.24 
 
 		 587 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>