More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2936 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  68.14 
 
 		 627 aa  771    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  89.78 
 
 		 648 aa  1132    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  58.58 
 
 		 625 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  68.32 
 
 		 692 aa  773    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  93.3 
 
 		 625 aa  1189    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  93.45 
 
 		 624 aa  1182    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  69.19 
 
 		 629 aa  783    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  68.14 
 
 		 627 aa  771    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  67.96 
 
 		 627 aa  768    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  68.14 
 
 		 626 aa  771    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  54.67 
 
 		 653 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  68.14 
 
 		 627 aa  771    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  93.93 
 
 		 624 aa  1198    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  97.76 
 
 		 626 aa  1222    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  67.96 
 
 		 627 aa  768    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 626 aa  1270    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  93.93 
 
 		 624 aa  1198    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  55.11 
 
 		 623 aa  632  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  55.95 
 
 		 618 aa  631  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  54.94 
 
 		 623 aa  630  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  58.23 
 
 		 628 aa  618  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  53.97 
 
 		 610 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  53.1 
 
 		 599 aa  608  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  55.41 
 
 		 621 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  56.67 
 
 		 596 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  56.67 
 
 		 598 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  56.24 
 
 		 596 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  54.13 
 
 		 596 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  54.96 
 
 		 623 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  53.96 
 
 		 624 aa  567  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  48.35 
 
 		 586 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  49.04 
 
 		 588 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  46.63 
 
 		 588 aa  509  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  46.96 
 
 		 588 aa  508  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  51.33 
 
 		 593 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  50.17 
 
 		 586 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  51.15 
 
 		 595 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  46.29 
 
 		 586 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  46.96 
 
 		 581 aa  498  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  49.18 
 
 		 669 aa  491  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  50.63 
 
 		 596 aa  488  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  46.97 
 
 		 580 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  48.27 
 
 		 662 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  50.09 
 
 		 588 aa  481  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  48.11 
 
 		 577 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  47.36 
 
 		 634 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  47.36 
 
 		 634 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  47.36 
 
 		 634 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  46.43 
 
 		 643 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  47.05 
 
 		 658 aa  458  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  47.56 
 
 		 696 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  48.13 
 
 		 595 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  45.83 
 
 		 662 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  45.52 
 
 		 662 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  44.73 
 
 		 652 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  46.83 
 
 		 691 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  45.92 
 
 		 648 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  46.67 
 
 		 661 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  46.67 
 
 		 661 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  46.5 
 
 		 661 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  46.5 
 
 		 660 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  45.77 
 
 		 583 aa  425  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  46.01 
 
 		 616 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  45.83 
 
 		 575 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  47.03 
 
 		 571 aa  403  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  42.88 
 
 		 572 aa  381  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  40.63 
 
 		 582 aa  372  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  47.83 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  41.95 
 
 		 619 aa  368  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  35.83 
 
 		 576 aa  324  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  37.32 
 
 		 578 aa  293  7e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  35.8 
 
 		 586 aa  289  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  35.9 
 
 		 589 aa  272  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  34.14 
 
 		 576 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  39.07 
 
 		 601 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  36.41 
 
 		 587 aa  270  8e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  32.92 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  34.4 
 
 		 580 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  37.57 
 
 		 595 aa  267  5.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  34.58 
 
 		 580 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  31.6 
 
 		 588 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00590  gamma-glutamyltranspeptidase  34.42 
 
 		 576 aa  265  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  34.58 
 
 		 580 aa  265  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  34.09 
 
 		 583 aa  263  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  33.81 
 
 		 580 aa  263  8e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  34.1 
 
 		 577 aa  263  8e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  33.81 
 
 		 580 aa  263  8e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  32.95 
 
 		 579 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  34.4 
 
 		 580 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  34.4 
 
 		 580 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  34.28 
 
 		 581 aa  262  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  32.23 
 
 		 599 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5929  gamma-glutamyltransferase  35.6 
 
 		 628 aa  262  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  33.86 
 
 		 580 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  33.63 
 
 		 580 aa  261  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  33.63 
 
 		 580 aa  261  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  37.35 
 
 		 583 aa  261  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  33.63 
 
 		 580 aa  261  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  33.63 
 
 		 581 aa  261  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  33.45 
 
 		 581 aa  261  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>