More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0825 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  66.22 
 
 
614 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
595 aa  1163    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1525  Gamma-glutamyltransferase  70.73 
 
 
596 aa  772    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0104264 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2332  gamma-glutamyltransferase  64.52 
 
 
602 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5929  gamma-glutamyltransferase  56.57 
 
 
628 aa  574  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5232  gamma-glutamyltransferase  58.53 
 
 
605 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14390  gamma-glutamyltransferase 1  55.98 
 
 
612 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220116  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2007  gamma-glutamyltransferase  56.01 
 
 
613 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3760  gamma-glutamyltransferase  54.69 
 
 
620 aa  555  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2611  gamma-glutamyltransferase  56.55 
 
 
646 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114881  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2446  gamma-glutamyltransferase  56.16 
 
 
624 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605656  normal  0.196083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  51.13 
 
 
579 aa  468  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  41.95 
 
 
593 aa  324  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  44.4 
 
 
595 aa  324  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  41.34 
 
 
586 aa  323  6e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  38.49 
 
 
580 aa  316  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  38.38 
 
 
589 aa  316  9e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  38.49 
 
 
580 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  40.75 
 
 
606 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  40.74 
 
 
588 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  42.8 
 
 
601 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  38.31 
 
 
580 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  38.31 
 
 
580 aa  313  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  38.31 
 
 
580 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  39.78 
 
 
596 aa  312  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  38.6 
 
 
588 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  39.64 
 
 
581 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  37.17 
 
 
581 aa  310  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  37.83 
 
 
581 aa  307  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  37.94 
 
 
576 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  37.94 
 
 
576 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  37.21 
 
 
586 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  38.81 
 
 
588 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  38.1 
 
 
577 aa  306  9.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  37.41 
 
 
579 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  37.64 
 
 
581 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  38.12 
 
 
580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  38.12 
 
 
580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  38.12 
 
 
580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  38.12 
 
 
580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  37.92 
 
 
580 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  38.64 
 
 
583 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  38.1 
 
 
581 aa  302  9e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  41.1 
 
 
595 aa  302  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  35.75 
 
 
581 aa  302  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  37 
 
 
556 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  36.64 
 
 
556 aa  300  5e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  36.35 
 
 
578 aa  299  8e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  36.68 
 
 
594 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  38.2 
 
 
617 aa  299  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  36.38 
 
 
599 aa  299  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  38.59 
 
 
584 aa  298  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  36.89 
 
 
576 aa  298  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  35.9 
 
 
582 aa  297  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  36.47 
 
 
586 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  35.12 
 
 
586 aa  295  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  37.05 
 
 
590 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  36.82 
 
 
645 aa  294  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  37.78 
 
 
579 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  39.77 
 
 
576 aa  292  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  37.78 
 
 
579 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  36.72 
 
 
579 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  36.72 
 
 
579 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  37.59 
 
 
579 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  37.28 
 
 
583 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  37.59 
 
 
579 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  36.72 
 
 
579 aa  291  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  36.26 
 
 
645 aa  290  4e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  36.11 
 
 
587 aa  290  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  37.48 
 
 
589 aa  289  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  33.68 
 
 
575 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  41.72 
 
 
619 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  37.85 
 
 
624 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  38.59 
 
 
653 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  37.22 
 
 
579 aa  288  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  33.62 
 
 
575 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  37.66 
 
 
624 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  37.66 
 
 
624 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  34.77 
 
 
575 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  34.28 
 
 
580 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  36.4 
 
 
578 aa  285  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  35.84 
 
 
581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  39.35 
 
 
624 aa  284  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  34.41 
 
 
579 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  37.8 
 
 
580 aa  283  7.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  37.48 
 
 
625 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  36 
 
 
586 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  38.37 
 
 
648 aa  281  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  37.95 
 
 
599 aa  280  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  39.85 
 
 
575 aa  279  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  37.57 
 
 
626 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  37.57 
 
 
626 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  37.92 
 
 
594 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  35 
 
 
604 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0138  gamma-glutamyltransferase  38.38 
 
 
570 aa  277  4e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  37.31 
 
 
596 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  37.83 
 
 
588 aa  276  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  36.68 
 
 
577 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  37.04 
 
 
583 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  36.64 
 
 
586 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>