More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2007 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14390  gamma-glutamyltransferase 1  60.78 
 
 		 612 aa  666    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3760  gamma-glutamyltransferase  75.48 
 
 		 620 aa  867    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2007  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 613 aa  1223    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1525  Gamma-glutamyltransferase  58.85 
 
 		 596 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0104264 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  57.26 
 
 		 614 aa  597  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2332  gamma-glutamyltransferase  58.71 
 
 		 602 aa  580  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167584  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  55.84 
 
 		 595 aa  579  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2611  gamma-glutamyltransferase  56.23 
 
 		 646 aa  580  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5929  gamma-glutamyltransferase  55.92 
 
 		 628 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2446  gamma-glutamyltransferase  56.68 
 
 		 624 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605656  normal  0.196083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5232  gamma-glutamyltransferase  55.97 
 
 		 605 aa  548  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  47.93 
 
 		 579 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  42.77 
 
 		 595 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  42.77 
 
 		 593 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  40.14 
 
 		 595 aa  333  8e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  40.34 
 
 		 596 aa  325  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  37.01 
 
 		 586 aa  320  5e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  40.62 
 
 		 601 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  35.26 
 
 		 581 aa  309  8e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  38.73 
 
 		 556 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  34.78 
 
 		 579 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  36.2 
 
 		 581 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  36.16 
 
 		 581 aa  306  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  35.24 
 
 		 577 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  34.52 
 
 		 580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  35.85 
 
 		 581 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  38.1 
 
 		 588 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  35.2 
 
 		 590 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  35.85 
 
 		 580 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  35.85 
 
 		 580 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  37.5 
 
 		 588 aa  304  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  35.85 
 
 		 580 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  35.85 
 
 		 580 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  34.52 
 
 		 580 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  37.99 
 
 		 556 aa  303  7.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  35.06 
 
 		 599 aa  303  9e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  37.16 
 
 		 588 aa  303  9e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  35.68 
 
 		 580 aa  302  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  34.52 
 
 		 580 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  34.8 
 
 		 580 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  35.49 
 
 		 583 aa  302  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  34.52 
 
 		 580 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  35.49 
 
 		 583 aa  301  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  34.91 
 
 		 582 aa  300  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  36.33 
 
 		 586 aa  299  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  35.33 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  35.19 
 
 		 617 aa  297  4e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  35.88 
 
 		 579 aa  296  6e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  37.02 
 
 		 580 aa  296  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  36.43 
 
 		 586 aa  296  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  34.33 
 
 		 576 aa  294  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  35.7 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  35.7 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  37.93 
 
 		 581 aa  293  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  34.63 
 
 		 645 aa  293  9e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  36.42 
 
 		 579 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  35.49 
 
 		 579 aa  290  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  36.42 
 
 		 579 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  36.42 
 
 		 579 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  37.11 
 
 		 576 aa  289  8e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  36.91 
 
 		 652 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  36.23 
 
 		 579 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  34.59 
 
 		 645 aa  288  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  38.17 
 
 		 584 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  37.33 
 
 		 589 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  36.4 
 
 		 594 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  34.8 
 
 		 580 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  35.85 
 
 		 589 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  35.05 
 
 		 581 aa  283  7.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  36.16 
 
 		 577 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  34.28 
 
 		 606 aa  283  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  33.44 
 
 		 586 aa  282  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0138  gamma-glutamyltransferase  37.28 
 
 		 570 aa  281  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  36.31 
 
 		 576 aa  281  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  38.56 
 
 		 577 aa  281  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  34.41 
 
 		 579 aa  278  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  34.67 
 
 		 604 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  37.93 
 
 		 575 aa  278  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  36.51 
 
 		 619 aa  277  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3208  gamma-glutamyltransferase  33.06 
 
 		 577 aa  276  5e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.295099  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  35.36 
 
 		 586 aa  273  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0093  gamma-glutamyltransferase  36.81 
 
 		 567 aa  270  4e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  34.85 
 
 		 587 aa  270  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  32.87 
 
 		 578 aa  269  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  36 
 
 		 610 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4414  gamma-glutamyltransferase  35.81 
 
 		 573 aa  267  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3336  gamma-glutamyltransferase  36.2 
 
 		 573 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4185  gamma-glutamyltransferase  36.2 
 
 		 573 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4181  gamma-glutamyltransferase  36.2 
 
 		 573 aa  267  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  33.56 
 
 		 578 aa  266  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  33.33 
 
 		 575 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2148  gamma-glutamyltranspeptidase  35.6 
 
 		 576 aa  265  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  34.85 
 
 		 575 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1850  gamma-glutamyltransferase 1  36.01 
 
 		 573 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0194  gamma-glutamyltransferase  32.97 
 
 		 668 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  36.17 
 
 		 594 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0200  gamma-glutamyltransferase  32.97 
 
 		 668 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  33.45 
 
 		 619 aa  265  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  33.45 
 
 		 626 aa  264  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  33.8 
 
 		 624 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>