More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5929 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5929  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
628 aa  1258    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  54.87 
 
 
614 aa  594  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3760  gamma-glutamyltransferase  54.19 
 
 
620 aa  590  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5232  gamma-glutamyltransferase  55.83 
 
 
605 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  55.67 
 
 
595 aa  580  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2007  gamma-glutamyltransferase  54.12 
 
 
613 aa  580  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408979  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2446  gamma-glutamyltransferase  53.9 
 
 
624 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605656  normal  0.196083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1525  Gamma-glutamyltransferase  54.59 
 
 
596 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0104264 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2611  gamma-glutamyltransferase  53.61 
 
 
646 aa  558  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114881  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2332  gamma-glutamyltransferase  55.88 
 
 
602 aa  553  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167584  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14390  gamma-glutamyltransferase 1  51.44 
 
 
612 aa  532  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220116  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  44.87 
 
 
579 aa  442  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  37.62 
 
 
588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  36.04 
 
 
588 aa  320  7e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  39.52 
 
 
596 aa  319  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  35.35 
 
 
588 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  41.8 
 
 
601 aa  313  6.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  39.34 
 
 
593 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  38.95 
 
 
587 aa  304  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  38.66 
 
 
595 aa  303  7.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  38.63 
 
 
581 aa  301  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  39.14 
 
 
595 aa  301  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  35.82 
 
 
581 aa  301  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  37.04 
 
 
586 aa  296  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  35.76 
 
 
586 aa  296  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  33.72 
 
 
586 aa  294  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  36.86 
 
 
586 aa  293  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  36.29 
 
 
580 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  35.5 
 
 
599 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  34.57 
 
 
579 aa  287  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  36.09 
 
 
577 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  33.56 
 
 
581 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  35.51 
 
 
589 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  35.28 
 
 
590 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  34.65 
 
 
617 aa  283  7.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  36.31 
 
 
599 aa  283  8.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  35.96 
 
 
626 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  36.18 
 
 
624 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  35.56 
 
 
579 aa  281  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  35.6 
 
 
626 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  35.56 
 
 
579 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  35.56 
 
 
579 aa  281  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  37.82 
 
 
624 aa  280  6e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  35.87 
 
 
576 aa  280  6e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  36.64 
 
 
625 aa  280  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  33.39 
 
 
580 aa  280  8e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  33.39 
 
 
580 aa  280  8e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  38.29 
 
 
575 aa  280  8e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  33.39 
 
 
580 aa  279  9e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  37.78 
 
 
583 aa  279  9e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  35.99 
 
 
624 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  33.39 
 
 
580 aa  279  9e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  35.99 
 
 
624 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  33.22 
 
 
580 aa  279  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  33.91 
 
 
576 aa  279  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  33.27 
 
 
645 aa  278  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  34.09 
 
 
577 aa  278  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  33.75 
 
 
645 aa  278  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  35.59 
 
 
606 aa  278  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  36.23 
 
 
648 aa  278  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  35.02 
 
 
653 aa  278  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  36.57 
 
 
619 aa  278  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  34.24 
 
 
581 aa  277  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  33.8 
 
 
583 aa  277  4e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  35.56 
 
 
556 aa  277  4e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  35.23 
 
 
579 aa  277  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  35.37 
 
 
556 aa  276  6e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  33.93 
 
 
581 aa  276  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  35.6 
 
 
579 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  37.1 
 
 
581 aa  276  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  35.6 
 
 
579 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  33.95 
 
 
582 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  35.41 
 
 
579 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  35.41 
 
 
579 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  33.61 
 
 
583 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  35.45 
 
 
580 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  33.96 
 
 
625 aa  269  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  36.47 
 
 
588 aa  269  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  34.66 
 
 
580 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  35.08 
 
 
580 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  35.12 
 
 
571 aa  268  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  34.6 
 
 
580 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  33.73 
 
 
580 aa  266  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  33.22 
 
 
619 aa  263  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  32.53 
 
 
604 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  34.3 
 
 
580 aa  263  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  34.07 
 
 
662 aa  263  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  35.49 
 
 
576 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  34.35 
 
 
594 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  35.98 
 
 
610 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  34.57 
 
 
598 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  34.01 
 
 
669 aa  259  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  33.45 
 
 
596 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  35.27 
 
 
589 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  34.34 
 
 
596 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  34.88 
 
 
579 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  34.23 
 
 
577 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0138  gamma-glutamyltransferase  34.98 
 
 
570 aa  253  7e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  34.03 
 
 
623 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  33.39 
 
 
578 aa  251  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>