More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2560 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 599 aa  1196    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  60.36 
 
 		 628 aa  678    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  61.73 
 
 		 618 aa  706    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  61.74 
 
 		 621 aa  702    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  61.27 
 
 		 623 aa  717    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  61.27 
 
 		 623 aa  719    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  56.21 
 
 		 648 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  56.21 
 
 		 624 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  56.38 
 
 		 624 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  56.21 
 
 		 624 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  55.86 
 
 		 625 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  55.86 
 
 		 626 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  55.69 
 
 		 626 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  52.8 
 
 		 610 aa  568  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  53.09 
 
 		 596 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  50.26 
 
 		 625 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  50 
 
 		 653 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  52.58 
 
 		 598 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  52.75 
 
 		 596 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  52.75 
 
 		 596 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  52.74 
 
 		 629 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  52.36 
 
 		 627 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  52.36 
 
 		 692 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  52.36 
 
 		 627 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  52.18 
 
 		 627 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  52.18 
 
 		 627 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  52.18 
 
 		 627 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  52.18 
 
 		 626 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  48.91 
 
 		 624 aa  504  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  49.83 
 
 		 623 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  46.64 
 
 		 586 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  44.18 
 
 		 580 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  51.27 
 
 		 588 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  45.88 
 
 		 586 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  46.62 
 
 		 669 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  49.2 
 
 		 595 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  44.14 
 
 		 581 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  44.25 
 
 		 586 aa  458  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  48.85 
 
 		 593 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  44.44 
 
 		 588 aa  458  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  45.32 
 
 		 634 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  45.32 
 
 		 634 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  44.66 
 
 		 588 aa  450  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  45.32 
 
 		 634 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  44.74 
 
 		 588 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  43.99 
 
 		 662 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  44.76 
 
 		 643 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  42.08 
 
 		 658 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  43.81 
 
 		 577 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  44.12 
 
 		 696 aa  425  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  47.3 
 
 		 595 aa  424  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  46.63 
 
 		 648 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  47.37 
 
 		 575 aa  413  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  47.1 
 
 		 596 aa  411  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  43.24 
 
 		 652 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  42.24 
 
 		 662 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  46.82 
 
 		 583 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  41.91 
 
 		 662 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  41.17 
 
 		 691 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  41.01 
 
 		 661 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  40.85 
 
 		 661 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  40.85 
 
 		 661 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  46.45 
 
 		 571 aa  396  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  42.41 
 
 		 616 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  41.42 
 
 		 660 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  44.42 
 
 		 619 aa  389  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  42.73 
 
 		 572 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  40.6 
 
 		 582 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  45.49 
 
 		 437 aa  327  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  38.81 
 
 		 578 aa  318  3e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  34.9 
 
 		 576 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  38.35 
 
 		 590 aa  280  4e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  39.73 
 
 		 601 aa  276  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00590  gamma-glutamyltranspeptidase  35.42 
 
 		 576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  34.84 
 
 		 599 aa  270  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  35.58 
 
 		 606 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  33.72 
 
 		 580 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0909  gamma-glutamyltransferase 1  35.05 
 
 		 590 aa  269  8.999999999999999e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.591211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  37.1 
 
 		 589 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  36.05 
 
 		 586 aa  268  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  34.99 
 
 		 587 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  39.13 
 
 		 595 aa  266  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  33.72 
 
 		 580 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  33.55 
 
 		 580 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  33.72 
 
 		 580 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  37 
 
 		 579 aa  265  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5929  gamma-glutamyltransferase  37.43 
 
 		 628 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  34.42 
 
 		 645 aa  262  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  33.39 
 
 		 580 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  33.75 
 
 		 581 aa  259  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  34.1 
 
 		 581 aa  259  7e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  35.88 
 
 		 587 aa  257  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  34.66 
 
 		 586 aa  258  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  33.99 
 
 		 576 aa  258  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  33.88 
 
 		 645 aa  258  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  35.08 
 
 		 576 aa  258  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  34.11 
 
 		 582 aa  257  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  33.39 
 
 		 583 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  34.12 
 
 		 617 aa  255  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  36.55 
 
 		 614 aa  254  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>