More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1410 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  57.89 
 
 
626 aa  640    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  57.37 
 
 
648 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  100 
 
 
628 aa  1274    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  82.78 
 
 
623 aa  1001    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  58.41 
 
 
625 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  60.36 
 
 
599 aa  709    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  71.6 
 
 
618 aa  856    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  58.58 
 
 
624 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  72.74 
 
 
621 aa  852    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  56.77 
 
 
624 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  56.77 
 
 
624 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  82.61 
 
 
623 aa  999    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  58.23 
 
 
626 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  52.25 
 
 
653 aa  586  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  51.87 
 
 
625 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  52.5 
 
 
596 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  54.59 
 
 
596 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  52.9 
 
 
596 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  51.8 
 
 
610 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  53.7 
 
 
629 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  53.46 
 
 
626 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  53.75 
 
 
692 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  53.46 
 
 
627 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  51.86 
 
 
598 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  53.4 
 
 
627 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  53.4 
 
 
627 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  53.23 
 
 
627 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  53.23 
 
 
627 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  51.09 
 
 
624 aa  524  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  50.25 
 
 
623 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  47.47 
 
 
586 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  46.97 
 
 
669 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  46.57 
 
 
588 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  47.12 
 
 
662 aa  472  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  46.13 
 
 
581 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  46.66 
 
 
580 aa  465  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  44.77 
 
 
658 aa  461  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  47.74 
 
 
643 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  46.05 
 
 
588 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  47.08 
 
 
588 aa  456  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  45.75 
 
 
588 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  46.37 
 
 
586 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  44.1 
 
 
586 aa  448  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  45.55 
 
 
577 aa  448  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  45.48 
 
 
634 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  45.48 
 
 
634 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  45.48 
 
 
634 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  48.13 
 
 
593 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  48.13 
 
 
595 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  47.12 
 
 
652 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  48.04 
 
 
596 aa  433  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  48.1 
 
 
571 aa  435  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  46.69 
 
 
572 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  42.95 
 
 
691 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  42.79 
 
 
661 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  44.79 
 
 
696 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  42.79 
 
 
661 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  44.03 
 
 
662 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  42.64 
 
 
661 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  43.86 
 
 
662 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  46.64 
 
 
648 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  44.03 
 
 
660 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  44.32 
 
 
616 aa  419  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  47.16 
 
 
595 aa  415  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  42.81 
 
 
582 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  45.24 
 
 
583 aa  395  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  46.19 
 
 
575 aa  392  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  42.93 
 
 
619 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  46.77 
 
 
437 aa  334  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  35.81 
 
 
576 aa  316  8e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  36.02 
 
 
578 aa  301  3e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  38.87 
 
 
590 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  33.16 
 
 
588 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00590  gamma-glutamyltranspeptidase  33.57 
 
 
576 aa  273  5.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  34.32 
 
 
581 aa  273  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  37.1 
 
 
606 aa  272  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  33.7 
 
 
599 aa  273  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  36.68 
 
 
586 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  35.15 
 
 
576 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  38.66 
 
 
579 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  35.03 
 
 
645 aa  268  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  35.04 
 
 
645 aa  266  5.999999999999999e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  35.02 
 
 
583 aa  265  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0909  gamma-glutamyltransferase 1  33.39 
 
 
590 aa  262  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.591211  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  35.44 
 
 
599 aa  259  8e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  36.59 
 
 
589 aa  258  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  33.87 
 
 
576 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  34.9 
 
 
582 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  33.74 
 
 
571 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1885  gamma-glutamyltransferase  34.15 
 
 
567 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1715  gamma-glutamyltransferase  33.27 
 
 
576 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  33.74 
 
 
579 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  34.22 
 
 
581 aa  254  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  35.18 
 
 
587 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  33.27 
 
 
578 aa  253  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  33.45 
 
 
575 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  34.51 
 
 
586 aa  253  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  35.28 
 
 
574 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  36.99 
 
 
601 aa  251  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  32.99 
 
 
575 aa  251  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>