More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00348 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  58.05 
 
 		 593 aa  688    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 588 aa  1214    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  59.59 
 
 		 596 aa  702    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  58.56 
 
 		 595 aa  694    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  73.81 
 
 		 588 aa  917    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  63.84 
 
 		 595 aa  691    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  90.29 
 
 		 588 aa  1112    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  62 
 
 		 586 aa  745    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  58.84 
 
 		 586 aa  689    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  63.29 
 
 		 581 aa  755    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  48.39 
 
 		 586 aa  563  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  50.09 
 
 		 577 aa  562  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  61.1 
 
 		 437 aa  551  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  47.77 
 
 		 580 aa  531  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  47.83 
 
 		 648 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  48.26 
 
 		 624 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  48.26 
 
 		 624 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  47.74 
 
 		 625 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  46.53 
 
 		 624 aa  509  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  47.91 
 
 		 624 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  48.08 
 
 		 626 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  47.56 
 
 		 626 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  44.98 
 
 		 625 aa  478  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  46.04 
 
 		 610 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  44.48 
 
 		 598 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  44.58 
 
 		 596 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  44.41 
 
 		 596 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  44.63 
 
 		 596 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  43.17 
 
 		 653 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  47.21 
 
 		 571 aa  458  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  44.79 
 
 		 588 aa  450  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  45.14 
 
 		 623 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  45.14 
 
 		 623 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  44.74 
 
 		 599 aa  445  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  45.49 
 
 		 575 aa  444  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  43.85 
 
 		 623 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  42.15 
 
 		 669 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  46.62 
 
 		 628 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  44.96 
 
 		 583 aa  435  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  43.93 
 
 		 618 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  43.24 
 
 		 627 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  43.42 
 
 		 692 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  43.24 
 
 		 627 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  43.24 
 
 		 627 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  43.24 
 
 		 627 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  43.42 
 
 		 627 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  43.42 
 
 		 626 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  40.53 
 
 		 662 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  40.2 
 
 		 658 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  43.84 
 
 		 621 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  41.76 
 
 		 619 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  41.97 
 
 		 582 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  39.83 
 
 		 643 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  42.52 
 
 		 652 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  40.68 
 
 		 634 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  42.03 
 
 		 648 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  40.68 
 
 		 634 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  40.68 
 
 		 634 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  41.29 
 
 		 696 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  42.35 
 
 		 629 aa  398  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  41.12 
 
 		 660 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  41.12 
 
 		 662 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  40.89 
 
 		 691 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  40.95 
 
 		 662 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  41.15 
 
 		 661 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  40.98 
 
 		 661 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  40.98 
 
 		 661 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  41.26 
 
 		 572 aa  385  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  38.91 
 
 		 616 aa  382  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  37.21 
 
 		 576 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  34.79 
 
 		 581 aa  347  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  37 
 
 		 599 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  36.58 
 
 		 576 aa  343  7e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  37.36 
 
 		 645 aa  340  5e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  37.18 
 
 		 645 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  36.46 
 
 		 578 aa  336  5.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  37.73 
 
 		 586 aa  336  7.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  34.24 
 
 		 582 aa  335  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  36.53 
 
 		 583 aa  332  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  34.67 
 
 		 579 aa  330  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  36.59 
 
 		 617 aa  330  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  35.91 
 
 		 583 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  37.41 
 
 		 579 aa  324  4e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  35.37 
 
 		 579 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  35.37 
 
 		 579 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  35.2 
 
 		 579 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  35.07 
 
 		 579 aa  320  5e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  35.07 
 
 		 579 aa  320  6e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  35.2 
 
 		 579 aa  320  6e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  35.74 
 
 		 580 aa  319  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  35.07 
 
 		 579 aa  319  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  37 
 
 		 556 aa  318  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  34.73 
 
 		 581 aa  318  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  35.88 
 
 		 580 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  33.68 
 
 		 588 aa  317  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  34.92 
 
 		 579 aa  316  8e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  36.63 
 
 		 556 aa  315  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  35.41 
 
 		 581 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  36.05 
 
 		 577 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  35.4 
 
 		 580 aa  313  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>