More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0482 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  73.33 
 
 		 596 aa  646    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  100 
 
 		 437 aa  879    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  73.06 
 
 		 595 aa  625  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  71.33 
 
 		 595 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  71.33 
 
 		 593 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  61.1 
 
 		 588 aa  551  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  61.42 
 
 		 586 aa  551  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  61.19 
 
 		 581 aa  550  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  59.5 
 
 		 588 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  58.9 
 
 		 588 aa  525  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  57.95 
 
 		 586 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  48.86 
 
 		 586 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  47.49 
 
 		 580 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  47.62 
 
 		 610 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  45.66 
 
 		 577 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  47.28 
 
 		 624 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  47.28 
 
 		 624 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  47.06 
 
 		 625 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  47.06 
 
 		 648 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  47.49 
 
 		 626 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  47.83 
 
 		 626 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  46.84 
 
 		 624 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  45.89 
 
 		 625 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  47.82 
 
 		 598 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  47.6 
 
 		 596 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  45.67 
 
 		 653 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  46.8 
 
 		 575 aa  360  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  48.47 
 
 		 596 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  47.38 
 
 		 596 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  47.1 
 
 		 624 aa  352  5.9999999999999994e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  45.67 
 
 		 623 aa  346  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  45.09 
 
 		 619 aa  344  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  45.15 
 
 		 618 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  46.61 
 
 		 571 aa  330  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  45.79 
 
 		 583 aa  330  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  46.93 
 
 		 628 aa  329  6e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  45.77 
 
 		 621 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  45.49 
 
 		 599 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  43.19 
 
 		 662 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  43.57 
 
 		 627 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  43.57 
 
 		 627 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  44.87 
 
 		 588 aa  323  4e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  44.82 
 
 		 623 aa  323  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  42.92 
 
 		 662 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  44.94 
 
 		 623 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  43.36 
 
 		 627 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  43.36 
 
 		 627 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  43.57 
 
 		 692 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  43.57 
 
 		 627 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  43.57 
 
 		 626 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  42.68 
 
 		 658 aa  317  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  41.84 
 
 		 669 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  42.14 
 
 		 629 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  41.09 
 
 		 616 aa  306  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  42.2 
 
 		 661 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  42.62 
 
 		 691 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  41.84 
 
 		 662 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  41.19 
 
 		 643 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  42 
 
 		 661 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  42 
 
 		 661 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  43.19 
 
 		 652 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  41.58 
 
 		 660 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  41.89 
 
 		 572 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  41.61 
 
 		 634 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  41.61 
 
 		 634 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  41.61 
 
 		 634 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  42.34 
 
 		 648 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  39.17 
 
 		 696 aa  283  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  38.94 
 
 		 582 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  36.75 
 
 		 576 aa  270  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5232  gamma-glutamyltransferase  39.77 
 
 		 605 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  36.1 
 
 		 576 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  37.03 
 
 		 578 aa  246  6.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  35.92 
 
 		 589 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  37.16 
 
 		 580 aa  239  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  41.73 
 
 		 614 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2332  gamma-glutamyltransferase  40.61 
 
 		 602 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167584  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  39.19 
 
 		 590 aa  237  3e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3760  gamma-glutamyltransferase  38.75 
 
 		 620 aa  237  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14390  gamma-glutamyltransferase 1  37.72 
 
 		 612 aa  236  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  33.56 
 
 		 582 aa  233  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  34.17 
 
 		 590 aa  233  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  34.81 
 
 		 606 aa  233  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  36.6 
 
 		 579 aa  233  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  34.59 
 
 		 581 aa  232  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  36.15 
 
 		 587 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  35.52 
 
 		 583 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2007  gamma-glutamyltransferase  38.79 
 
 		 613 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408979  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  38.92 
 
 		 595 aa  231  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  34.98 
 
 		 578 aa  230  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  33.78 
 
 		 579 aa  229  8e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  34.77 
 
 		 587 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  35.96 
 
 		 586 aa  229  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0138  gamma-glutamyltransferase  34.37 
 
 		 570 aa  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  34.15 
 
 		 579 aa  226  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  37.66 
 
 		 601 aa  226  7e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  33.48 
 
 		 583 aa  224  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2446  gamma-glutamyltransferase  37.82 
 
 		 624 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605656  normal  0.196083 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 		 579 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 		 579 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>