More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2921 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  61.74 
 
 		 596 aa  699    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  100 
 
 		 623 aa  1237    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  61.39 
 
 		 596 aa  697    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  68.08 
 
 		 625 aa  862    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  62.8 
 
 		 610 aa  761    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  69.54 
 
 		 653 aa  874    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  61.57 
 
 		 598 aa  695    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  61.74 
 
 		 596 aa  693    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  54.84 
 
 		 625 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  54.77 
 
 		 624 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  54.77 
 
 		 624 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  56.4 
 
 		 624 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  56.06 
 
 		 648 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  56.06 
 
 		 626 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  54.43 
 
 		 626 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  55.08 
 
 		 627 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  55.26 
 
 		 692 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  55.08 
 
 		 627 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  55.08 
 
 		 627 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  55.08 
 
 		 627 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  55.79 
 
 		 629 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  55.08 
 
 		 626 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  55.08 
 
 		 627 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  51.09 
 
 		 623 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  51.09 
 
 		 623 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  50.08 
 
 		 624 aa  531  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  49.83 
 
 		 599 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  50.84 
 
 		 628 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  49.75 
 
 		 618 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  50.92 
 
 		 621 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  45.48 
 
 		 586 aa  488  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  46.57 
 
 		 669 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  48.85 
 
 		 593 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  49.02 
 
 		 595 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  44.32 
 
 		 588 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  43.85 
 
 		 588 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  47.44 
 
 		 586 aa  457  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  43.5 
 
 		 588 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  46.37 
 
 		 643 aa  450  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  43.58 
 
 		 581 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  46.05 
 
 		 652 aa  443  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  46.06 
 
 		 577 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  45.34 
 
 		 662 aa  445  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  48.68 
 
 		 588 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  43.77 
 
 		 586 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  44.64 
 
 		 634 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  44.64 
 
 		 634 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  44.64 
 
 		 634 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  42.73 
 
 		 580 aa  432  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  44.14 
 
 		 658 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  44.3 
 
 		 661 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  44.3 
 
 		 691 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  45.13 
 
 		 596 aa  413  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  44.3 
 
 		 661 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  42.4 
 
 		 662 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  44.14 
 
 		 661 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  42.71 
 
 		 662 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  43.23 
 
 		 696 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  43.99 
 
 		 648 aa  405  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  43.56 
 
 		 660 aa  405  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  44.1 
 
 		 616 aa  405  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  44.62 
 
 		 595 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  44.27 
 
 		 571 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  44.82 
 
 		 575 aa  385  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  42.25 
 
 		 572 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  43.01 
 
 		 583 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  42.81 
 
 		 619 aa  364  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  38.35 
 
 		 582 aa  351  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  45.89 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  35.84 
 
 		 576 aa  317  6e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  37.6 
 
 		 578 aa  298  2e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  39 
 
 		 590 aa  273  7e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  33.16 
 
 		 617 aa  268  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  34.73 
 
 		 576 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00590  gamma-glutamyltranspeptidase  33.11 
 
 		 576 aa  264  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  32.65 
 
 		 599 aa  263  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  32.9 
 
 		 581 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  35.28 
 
 		 586 aa  259  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  32.86 
 
 		 582 aa  259  9e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  34.09 
 
 		 583 aa  259  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  33.8 
 
 		 571 aa  256  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  34.39 
 
 		 580 aa  256  8e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  35.53 
 
 		 580 aa  256  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  35.35 
 
 		 580 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  37.64 
 
 		 579 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  32.23 
 
 		 579 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  35.53 
 
 		 580 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  34.58 
 
 		 576 aa  253  9.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  35.23 
 
 		 587 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  32.57 
 
 		 588 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  33.11 
 
 		 593 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  33.6 
 
 		 589 aa  252  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0138  gamma-glutamyltransferase  34.14 
 
 		 570 aa  251  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  38.71 
 
 		 601 aa  251  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  35.35 
 
 		 580 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  34.95 
 
 		 579 aa  251  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  35.16 
 
 		 580 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  31.63 
 
 		 645 aa  250  5e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  34.17 
 
 		 581 aa  250  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5232  gamma-glutamyltransferase  36.44 
 
 		 605 aa  250  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>