More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00590 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00590  gamma-glutamyltranspeptidase  100 
 
 
576 aa  1194    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1885  gamma-glutamyltransferase  62.76 
 
 
567 aa  684    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1715  gamma-glutamyltransferase  52.01 
 
 
576 aa  554  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4521  gamma-glutamyltransferase  50.53 
 
 
555 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229347  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0268  gamma-glutamyltranspeptidase  52.7 
 
 
573 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0755298  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4659  gamma-glutamyltransferase  50.36 
 
 
555 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4654  gamma-glutamyltransferase  50.71 
 
 
555 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0996  gamma-glutamyltranspeptidase  52.7 
 
 
573 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.030898  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1328  gamma-glutamyltranspeptidase  52.7 
 
 
573 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600638  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0297  gamma-glutamyltransferase  52.7 
 
 
573 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.58924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1823  gamma-glutamyltransferase  52.7 
 
 
573 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.496785  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1739  gamma-glutamyltransferase  52.7 
 
 
573 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0371  gamma-glutamyltranspeptidase  52.7 
 
 
573 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.220904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0777  gamma-glutamyltransferase  49.74 
 
 
555 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4047  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  53.3 
 
 
557 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4414  gamma-glutamyltransferase  52.35 
 
 
573 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1134  gamma-glutamyltransferase  50.18 
 
 
573 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105018  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4068  gamma-glutamyltransferase  51.97 
 
 
573 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00343231  normal  0.979894 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3593  gamma-glutamyltransferase  51.97 
 
 
573 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46960  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  52.92 
 
 
557 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199873  normal  0.0147072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3336  gamma-glutamyltransferase  51.97 
 
 
573 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1850  gamma-glutamyltransferase 1  51.59 
 
 
573 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4185  gamma-glutamyltransferase  51.97 
 
 
573 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4181  gamma-glutamyltransferase  51.97 
 
 
573 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2484  gamma-glutamyltransferase  49.82 
 
 
557 aa  537  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4301  gamma-glutamyltransferase  48.94 
 
 
577 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3857  gamma-glutamyltransferase  51.11 
 
 
585 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168066  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0629  gamma-glutamyltransferase 1  48.14 
 
 
577 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.495929  decreased coverage  0.00747433 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1616  gamma-glutamyltransferase  48.02 
 
 
592 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.642226  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2827  gamma-glutamyltransferase  48.14 
 
 
584 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0328674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5927  gamma-glutamyltransferase  47.64 
 
 
566 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.779153  normal  0.531425 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  48 
 
 
580 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1308  gamma-glutamyltransferase 1  42.76 
 
 
584 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  46.73 
 
 
586 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  42.71 
 
 
579 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  46.91 
 
 
571 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  47.6 
 
 
576 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  46.8 
 
 
581 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  46.8 
 
 
580 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  46.51 
 
 
580 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  46.8 
 
 
580 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  44.9 
 
 
577 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  45.4 
 
 
645 aa  436  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  43.22 
 
 
590 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  44.36 
 
 
576 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  46.8 
 
 
580 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  41.46 
 
 
599 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  46.51 
 
 
580 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  44.61 
 
 
576 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  44.57 
 
 
581 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  46.8 
 
 
580 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  44.57 
 
 
581 aa  438  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  46.4 
 
 
580 aa  434  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  46.31 
 
 
580 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  43.16 
 
 
581 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  41.32 
 
 
582 aa  435  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  46.11 
 
 
580 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  44.83 
 
 
645 aa  433  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  46.71 
 
 
587 aa  432  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  46.11 
 
 
580 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  41.3 
 
 
579 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  42.44 
 
 
588 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  47.09 
 
 
581 aa  432  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  43.36 
 
 
579 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  45.91 
 
 
556 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  43.36 
 
 
579 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  45.71 
 
 
556 aa  426  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  42.18 
 
 
579 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  43.18 
 
 
579 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  42.18 
 
 
579 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  42.36 
 
 
579 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  43.18 
 
 
579 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4506  gamma-glutamyltransferase  44.67 
 
 
560 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  43.3 
 
 
617 aa  419  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  41.26 
 
 
583 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08826  gamma-glutamyltranspeptidase  44.01 
 
 
563 aa  417  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  46.08 
 
 
606 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  42.24 
 
 
583 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  44.04 
 
 
619 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  44.78 
 
 
589 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4652  gamma-glutamyltransferase  43.55 
 
 
602 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467569  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  43.53 
 
 
578 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  43.32 
 
 
575 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  43.63 
 
 
575 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  40.11 
 
 
583 aa  399  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  42.05 
 
 
578 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  44.24 
 
 
579 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  39.15 
 
 
583 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  42.94 
 
 
575 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  40.29 
 
 
594 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  43.11 
 
 
583 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  43.2 
 
 
588 aa  395  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  39.19 
 
 
583 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  39.11 
 
 
583 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  39.29 
 
 
583 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  39.19 
 
 
583 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  42.94 
 
 
578 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  42.5 
 
 
576 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  42.46 
 
 
586 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  42.5 
 
 
576 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>