More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3593 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0268  gamma-glutamyltranspeptidase  85.04 
 
 		 573 aa  1004    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0755298  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4659  gamma-glutamyltransferase  62.15 
 
 		 555 aa  672    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1739  gamma-glutamyltransferase  85.22 
 
 		 573 aa  1006    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1616  gamma-glutamyltransferase  68.54 
 
 		 592 aa  773    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.642226  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4521  gamma-glutamyltransferase  61.97 
 
 		 555 aa  670    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229347  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0996  gamma-glutamyltranspeptidase  85.04 
 
 		 573 aa  1004    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.030898  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4301  gamma-glutamyltransferase  79.83 
 
 		 577 aa  949    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0371  gamma-glutamyltranspeptidase  85.04 
 
 		 573 aa  1004    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.220904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2484  gamma-glutamyltransferase  64.01 
 
 		 557 aa  689    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0297  gamma-glutamyltransferase  85.04 
 
 		 573 aa  1006    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.58924  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2827  gamma-glutamyltransferase  65.32 
 
 		 584 aa  728    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0328674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1850  gamma-glutamyltransferase 1  96.68 
 
 		 573 aa  1137    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1134  gamma-glutamyltransferase  85.74 
 
 		 573 aa  1010    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105018  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3336  gamma-glutamyltransferase  97.21 
 
 		 573 aa  1143    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3857  gamma-glutamyltransferase  79.51 
 
 		 585 aa  927    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1308  gamma-glutamyltransferase 1  63.97 
 
 		 584 aa  732    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0629  gamma-glutamyltransferase 1  80.35 
 
 		 577 aa  932    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.495929  decreased coverage  0.00747433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4047  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  62.57 
 
 		 557 aa  670    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4185  gamma-glutamyltransferase  97.21 
 
 		 573 aa  1143    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4654  gamma-glutamyltransferase  61.97 
 
 		 555 aa  668    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0777  gamma-glutamyltransferase  60.25 
 
 		 555 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1823  gamma-glutamyltransferase  85.22 
 
 		 573 aa  1006    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.496785  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1328  gamma-glutamyltranspeptidase  85.04 
 
 		 573 aa  1004    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600638  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4414  gamma-glutamyltransferase  95.11 
 
 		 573 aa  1126    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3593  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 573 aa  1166    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46960  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  62.76 
 
 		 557 aa  672    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199873  normal  0.0147072 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4068  gamma-glutamyltransferase  99.48 
 
 		 573 aa  1162    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00343231  normal  0.979894 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4181  gamma-glutamyltransferase  97.21 
 
 		 573 aa  1143    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1715  gamma-glutamyltransferase  51.99 
 
 		 576 aa  548  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00590  gamma-glutamyltranspeptidase  51.97 
 
 		 576 aa  544  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1885  gamma-glutamyltransferase  53.4 
 
 		 567 aa  545  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  47.22 
 
 		 556 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  47.22 
 
 		 556 aa  458  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  45.95 
 
 		 576 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  45.61 
 
 		 645 aa  436  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  45.77 
 
 		 580 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  42.46 
 
 		 579 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  45.22 
 
 		 586 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  44.04 
 
 		 588 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  45.87 
 
 		 587 aa  430  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  44.51 
 
 		 583 aa  431  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  45.57 
 
 		 645 aa  432  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  40.82 
 
 		 581 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  43.66 
 
 		 571 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  43.23 
 
 		 579 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  43.06 
 
 		 579 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  43.06 
 
 		 579 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  43.5 
 
 		 580 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  44.14 
 
 		 579 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  44.26 
 
 		 579 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  42.75 
 
 		 599 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  44.26 
 
 		 579 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  43.37 
 
 		 580 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  44.08 
 
 		 579 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  44.26 
 
 		 579 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  45.51 
 
 		 581 aa  421  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4652  gamma-glutamyltransferase  46.34 
 
 		 602 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4506  gamma-glutamyltransferase  43.6 
 
 		 560 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  42.25 
 
 		 582 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  44.07 
 
 		 617 aa  419  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  43.2 
 
 		 580 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  43.37 
 
 		 580 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  44.57 
 
 		 590 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  44.57 
 
 		 580 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  44.57 
 
 		 580 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  44.96 
 
 		 575 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  44.57 
 
 		 581 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  44.19 
 
 		 581 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  44.75 
 
 		 577 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  43.03 
 
 		 580 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  44.57 
 
 		 580 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  44.57 
 
 		 580 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  43.95 
 
 		 589 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  44.2 
 
 		 580 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  45.38 
 
 		 583 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  43.08 
 
 		 578 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  44.76 
 
 		 588 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  45.55 
 
 		 583 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  43.58 
 
 		 576 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  44.38 
 
 		 581 aa  415  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5927  gamma-glutamyltransferase  44.07 
 
 		 566 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.779153  normal  0.531425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  44.56 
 
 		 575 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  42.97 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  42.13 
 
 		 579 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  44.24 
 
 		 606 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  45.34 
 
 		 583 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  42.57 
 
 		 583 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  43.69 
 
 		 576 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  44.85 
 
 		 575 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  44.44 
 
 		 576 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  44.85 
 
 		 583 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  43.69 
 
 		 576 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  43.81 
 
 		 587 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  44.85 
 
 		 583 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  44.24 
 
 		 578 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  43.57 
 
 		 586 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  42.86 
 
 		 610 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  44.81 
 
 		 587 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  44.65 
 
 		 583 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  41.52 
 
 		 586 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>