More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2827 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0268  gamma-glutamyltranspeptidase  65.85 
 
 		 573 aa  764    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0755298  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3857  gamma-glutamyltransferase  64.8 
 
 		 585 aa  758    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2827  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 584 aa  1185    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0328674 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0371  gamma-glutamyltranspeptidase  65.85 
 
 		 573 aa  764    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.220904  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0996  gamma-glutamyltranspeptidase  65.85 
 
 		 573 aa  764    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.030898  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3336  gamma-glutamyltransferase  64.69 
 
 		 573 aa  756    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1739  gamma-glutamyltransferase  66.02 
 
 		 573 aa  766    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0297  gamma-glutamyltransferase  66.02 
 
 		 573 aa  767    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.58924  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1616  gamma-glutamyltransferase  80.84 
 
 		 592 aa  916    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.642226  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1850  gamma-glutamyltransferase 1  64.69 
 
 		 573 aa  760    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1134  gamma-glutamyltransferase  66.73 
 
 		 573 aa  776    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1308  gamma-glutamyltransferase 1  91.61 
 
 		 584 aa  1075    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0629  gamma-glutamyltransferase 1  64.35 
 
 		 577 aa  765    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.495929  decreased coverage  0.00747433 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4185  gamma-glutamyltransferase  64.69 
 
 		 573 aa  756    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4068  gamma-glutamyltransferase  64.16 
 
 		 573 aa  751    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00343231  normal  0.979894 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1823  gamma-glutamyltransferase  66.02 
 
 		 573 aa  766    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.496785  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4301  gamma-glutamyltransferase  65.43 
 
 		 577 aa  770    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3593  gamma-glutamyltransferase  64.16 
 
 		 573 aa  752    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4414  gamma-glutamyltransferase  63.99 
 
 		 573 aa  752    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4181  gamma-glutamyltransferase  64.69 
 
 		 573 aa  756    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1328  gamma-glutamyltranspeptidase  65.85 
 
 		 573 aa  764    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4047  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  59.44 
 
 		 557 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4659  gamma-glutamyltransferase  56.08 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4521  gamma-glutamyltransferase  56.08 
 
 		 555 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229347  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4654  gamma-glutamyltransferase  56.08 
 
 		 555 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46960  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  59.25 
 
 		 557 aa  625  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199873  normal  0.0147072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2484  gamma-glutamyltransferase  56.44 
 
 		 557 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0777  gamma-glutamyltransferase  56.52 
 
 		 555 aa  611  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1715  gamma-glutamyltransferase  50.36 
 
 		 576 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1885  gamma-glutamyltransferase  49.43 
 
 		 567 aa  499  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00590  gamma-glutamyltranspeptidase  45.75 
 
 		 576 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  41.9 
 
 		 556 aa  403  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  43.42 
 
 		 582 aa  403  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  41.9 
 
 		 556 aa  405  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  42.37 
 
 		 599 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  42.48 
 
 		 579 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  42.29 
 
 		 581 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  42.58 
 
 		 588 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  44.07 
 
 		 581 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  45.22 
 
 		 589 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  41.59 
 
 		 587 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  41.2 
 
 		 571 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  43.75 
 
 		 581 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  42.14 
 
 		 577 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  43.8 
 
 		 586 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  41.81 
 
 		 583 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  43.04 
 
 		 580 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  43.31 
 
 		 580 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  43.13 
 
 		 580 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4652  gamma-glutamyltransferase  44.74 
 
 		 602 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  40.64 
 
 		 590 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  43.31 
 
 		 580 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  43.31 
 
 		 580 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  42.73 
 
 		 576 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  43.31 
 
 		 580 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  43.45 
 
 		 606 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  43.42 
 
 		 579 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  42.94 
 
 		 581 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  42.1 
 
 		 580 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  41.92 
 
 		 580 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  42.05 
 
 		 583 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  43.05 
 
 		 579 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5927  gamma-glutamyltransferase  44.53 
 
 		 566 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.779153  normal  0.531425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  43.23 
 
 		 579 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  40.75 
 
 		 576 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  42.75 
 
 		 581 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  41.92 
 
 		 580 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  43.23 
 
 		 579 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  42.67 
 
 		 579 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  42.86 
 
 		 579 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  43.23 
 
 		 579 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  40.56 
 
 		 583 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  42.86 
 
 		 579 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08826  gamma-glutamyltranspeptidase  40.77 
 
 		 563 aa  373  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  40.37 
 
 		 583 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  41.92 
 
 		 580 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  41.31 
 
 		 645 aa  371  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  41.73 
 
 		 576 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  41.75 
 
 		 580 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  41.31 
 
 		 645 aa  372  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  41.67 
 
 		 583 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  41.67 
 
 		 583 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  41.28 
 
 		 583 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4506  gamma-glutamyltransferase  40.12 
 
 		 560 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  40.48 
 
 		 583 aa  364  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  43.29 
 
 		 575 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  40.8 
 
 		 575 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  40.42 
 
 		 575 aa  360  5e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  40 
 
 		 617 aa  359  7e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  38.87 
 
 		 587 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  41.43 
 
 		 588 aa  358  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  42.48 
 
 		 583 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  43.11 
 
 		 586 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  40.24 
 
 		 587 aa  356  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  40.04 
 
 		 587 aa  355  8.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  38.69 
 
 		 587 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  39.89 
 
 		 578 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  39.24 
 
 		 597 aa  353  4e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  38.14 
 
 		 587 aa  353  5e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  42.4 
 
 		 610 aa  353  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>