More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1885 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00590  gamma-glutamyltranspeptidase  62.74 
 
 		 576 aa  690    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1885  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 567 aa  1167    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1715  gamma-glutamyltransferase  54.51 
 
 		 576 aa  594  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1328  gamma-glutamyltranspeptidase  53.93 
 
 		 573 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600638  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4068  gamma-glutamyltransferase  53.36 
 
 		 573 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00343231  normal  0.979894 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0996  gamma-glutamyltranspeptidase  53.93 
 
 		 573 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.030898  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4414  gamma-glutamyltransferase  53.36 
 
 		 573 aa  551  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0268  gamma-glutamyltranspeptidase  53.93 
 
 		 573 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0755298  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0297  gamma-glutamyltransferase  54.12 
 
 		 573 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.58924  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0371  gamma-glutamyltranspeptidase  53.93 
 
 		 573 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.220904  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1739  gamma-glutamyltransferase  53.93 
 
 		 573 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1823  gamma-glutamyltransferase  53.93 
 
 		 573 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.496785  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3593  gamma-glutamyltransferase  53.36 
 
 		 573 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4185  gamma-glutamyltransferase  53.36 
 
 		 573 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3336  gamma-glutamyltransferase  53.36 
 
 		 573 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0777  gamma-glutamyltransferase  52.31 
 
 		 555 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4181  gamma-glutamyltransferase  53.36 
 
 		 573 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4659  gamma-glutamyltransferase  51.27 
 
 		 555 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4654  gamma-glutamyltransferase  51.27 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1850  gamma-glutamyltransferase 1  52.9 
 
 		 573 aa  544  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1134  gamma-glutamyltransferase  53.75 
 
 		 573 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105018  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4521  gamma-glutamyltransferase  51.27 
 
 		 555 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229347  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3857  gamma-glutamyltransferase  50.09 
 
 		 585 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4301  gamma-glutamyltransferase  52.06 
 
 		 577 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4047  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  51.98 
 
 		 557 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0629  gamma-glutamyltransferase 1  49.73 
 
 		 577 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.495929  decreased coverage  0.00747433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2484  gamma-glutamyltransferase  51.49 
 
 		 557 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46960  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  52.17 
 
 		 557 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199873  normal  0.0147072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2827  gamma-glutamyltransferase  49.63 
 
 		 584 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0328674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1616  gamma-glutamyltransferase  50.47 
 
 		 592 aa  485  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.642226  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1308  gamma-glutamyltransferase 1  47.75 
 
 		 584 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  45.78 
 
 		 586 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  44.82 
 
 		 571 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5927  gamma-glutamyltransferase  45.5 
 
 		 566 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.779153  normal  0.531425 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  47.98 
 
 		 580 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  44.36 
 
 		 588 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  46.05 
 
 		 556 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  45.85 
 
 		 556 aa  437  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  45.27 
 
 		 576 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  43.44 
 
 		 576 aa  435  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  46.32 
 
 		 581 aa  435  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  46.03 
 
 		 580 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  45.69 
 
 		 580 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  42.83 
 
 		 583 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  45.45 
 
 		 581 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  45.51 
 
 		 580 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  44.94 
 
 		 581 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  45.51 
 
 		 580 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  44.09 
 
 		 577 aa  425  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  44.89 
 
 		 580 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  44.89 
 
 		 580 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  44.16 
 
 		 579 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  44.89 
 
 		 580 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  46.67 
 
 		 587 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  46.86 
 
 		 599 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  45.32 
 
 		 580 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  44.89 
 
 		 580 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4506  gamma-glutamyltransferase  44.33 
 
 		 560 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  45.92 
 
 		 576 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  44.51 
 
 		 580 aa  422  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4652  gamma-glutamyltransferase  47.22 
 
 		 602 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  44.38 
 
 		 590 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  44.89 
 
 		 582 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  43.89 
 
 		 581 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  45.51 
 
 		 588 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  45.82 
 
 		 581 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08826  gamma-glutamyltranspeptidase  42.33 
 
 		 563 aa  414  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  44.46 
 
 		 583 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  44.23 
 
 		 583 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  44.55 
 
 		 579 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  45.36 
 
 		 579 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  44.72 
 
 		 606 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  44.75 
 
 		 579 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  46.57 
 
 		 645 aa  410  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  44.75 
 
 		 579 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  44.95 
 
 		 579 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  44.42 
 
 		 617 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  44.55 
 
 		 579 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  44.55 
 
 		 579 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  44.95 
 
 		 579 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  42.26 
 
 		 619 aa  408  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  45.91 
 
 		 645 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  42.35 
 
 		 578 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  44.9 
 
 		 575 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  40.87 
 
 		 589 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  44.4 
 
 		 599 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  41.28 
 
 		 586 aa  400  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  41.28 
 
 		 578 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  42.91 
 
 		 583 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  38.68 
 
 		 593 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  43.2 
 
 		 579 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  40.96 
 
 		 583 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  40.96 
 
 		 583 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  43.76 
 
 		 575 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  41.62 
 
 		 581 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  41.93 
 
 		 583 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  43.47 
 
 		 575 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4900  gamma-glutamyltransferase  42.48 
 
 		 617 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608373  normal  0.737431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  43.87 
 
 		 586 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  42.13 
 
 		 583 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>