More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0960 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  82.61 
 
 
628 aa  974    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  54.19 
 
 
625 aa  638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
623 aa  1269    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  99.84 
 
 
623 aa  1266    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  54.74 
 
 
624 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  72.7 
 
 
621 aa  867    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  71.24 
 
 
618 aa  873    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  55.41 
 
 
624 aa  638    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  54.74 
 
 
624 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  60.32 
 
 
599 aa  726    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  56.07 
 
 
626 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  55.78 
 
 
648 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  55.74 
 
 
626 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  52.58 
 
 
653 aa  585  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  52.69 
 
 
625 aa  581  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  52.61 
 
 
610 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  53.51 
 
 
596 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  53.6 
 
 
626 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  53.6 
 
 
627 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  53.71 
 
 
692 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  54.03 
 
 
596 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  53.49 
 
 
629 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  53.34 
 
 
598 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  53.37 
 
 
627 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  53.37 
 
 
627 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  52.84 
 
 
596 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  53.2 
 
 
627 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  53.2 
 
 
627 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  48.62 
 
 
624 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  50.76 
 
 
623 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  48.29 
 
 
669 aa  488  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  48.47 
 
 
586 aa  488  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  47.64 
 
 
662 aa  477  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  45.78 
 
 
658 aa  465  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  47.03 
 
 
643 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  48.62 
 
 
588 aa  464  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  46.18 
 
 
588 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  46.54 
 
 
586 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  45.18 
 
 
634 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  45.18 
 
 
634 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  45.18 
 
 
634 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  44.81 
 
 
581 aa  458  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  45.14 
 
 
588 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  47.99 
 
 
593 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  45.67 
 
 
580 aa  449  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  47.82 
 
 
595 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  45.14 
 
 
588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  45.3 
 
 
577 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  45.03 
 
 
586 aa  438  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  47.07 
 
 
571 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  46.39 
 
 
652 aa  433  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  44.91 
 
 
660 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  47.02 
 
 
648 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  45.07 
 
 
662 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  47.55 
 
 
596 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  45.07 
 
 
662 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  44.43 
 
 
691 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  45.48 
 
 
696 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  44.43 
 
 
661 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  46.68 
 
 
572 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  44.43 
 
 
661 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  44.26 
 
 
661 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  46.6 
 
 
595 aa  421  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  44.07 
 
 
616 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  43.45 
 
 
582 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  44.62 
 
 
583 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  44.93 
 
 
575 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  43.15 
 
 
619 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  44.82 
 
 
437 aa  323  6e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  35.26 
 
 
576 aa  318  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  35.13 
 
 
578 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  35.26 
 
 
581 aa  280  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  38.28 
 
 
590 aa  279  9e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  36.49 
 
 
576 aa  279  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  36.02 
 
 
582 aa  276  9e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  35.92 
 
 
599 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  36.33 
 
 
606 aa  274  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00590  gamma-glutamyltranspeptidase  33.39 
 
 
576 aa  274  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  38.72 
 
 
601 aa  271  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  36.16 
 
 
586 aa  270  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  31.72 
 
 
588 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  35.06 
 
 
645 aa  268  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  32.82 
 
 
571 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  37.17 
 
 
586 aa  267  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5927  gamma-glutamyltransferase  33.56 
 
 
566 aa  266  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.779153  normal  0.531425 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1715  gamma-glutamyltransferase  34.36 
 
 
576 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  38.21 
 
 
579 aa  266  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  34.78 
 
 
645 aa  265  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  34.29 
 
 
583 aa  265  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3208  gamma-glutamyltransferase  36.92 
 
 
577 aa  264  4.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.295099  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  37.35 
 
 
583 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  35.19 
 
 
599 aa  262  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  35.58 
 
 
610 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  36.13 
 
 
589 aa  259  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  35.32 
 
 
583 aa  259  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  34.77 
 
 
587 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  33.66 
 
 
580 aa  257  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  34.51 
 
 
581 aa  256  8e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  33.49 
 
 
580 aa  256  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4301  gamma-glutamyltransferase  33.51 
 
 
577 aa  256  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.450186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>