More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001611 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  100 
 
 		 576 aa  1182    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  37.21 
 
 		 588 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  37.21 
 
 		 588 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  38.34 
 
 		 588 aa  372  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  37.52 
 
 		 586 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  37.48 
 
 		 581 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  37.09 
 
 		 586 aa  362  8e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  38.69 
 
 		 580 aa  360  5e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  36.63 
 
 		 595 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  36.63 
 
 		 593 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  35.66 
 
 		 577 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  37.41 
 
 		 598 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  37.23 
 
 		 596 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  37.16 
 
 		 596 aa  340  4e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  36.01 
 
 		 596 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  37.24 
 
 		 625 aa  332  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  35.87 
 
 		 586 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  36.02 
 
 		 596 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  37.63 
 
 		 618 aa  329  8e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  37.39 
 
 		 653 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  36.56 
 
 		 625 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  36.93 
 
 		 588 aa  326  6e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  36.06 
 
 		 624 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  35.83 
 
 		 626 aa  324  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  35.73 
 
 		 624 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  35.78 
 
 		 648 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  35.73 
 
 		 624 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  37.74 
 
 		 624 aa  320  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  35.76 
 
 		 610 aa  319  7e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  35.67 
 
 		 626 aa  319  7e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  36.97 
 
 		 583 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  35.86 
 
 		 575 aa  318  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  36.6 
 
 		 623 aa  316  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  36.6 
 
 		 623 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  36.11 
 
 		 627 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  36.11 
 
 		 627 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  36.11 
 
 		 692 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  36.11 
 
 		 627 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  36.11 
 
 		 626 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  36 
 
 		 595 aa  310  5e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  35.93 
 
 		 627 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  35.93 
 
 		 627 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  34.9 
 
 		 599 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  35.73 
 
 		 623 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  35.52 
 
 		 571 aa  301  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  34.36 
 
 		 619 aa  296  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  36.82 
 
 		 628 aa  296  7e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  36.99 
 
 		 669 aa  296  8e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  36.01 
 
 		 629 aa  294  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  32.41 
 
 		 658 aa  293  6e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  37.17 
 
 		 621 aa  292  9e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  35.04 
 
 		 652 aa  291  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  34.84 
 
 		 572 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  33.52 
 
 		 606 aa  286  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  33.57 
 
 		 583 aa  277  4e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  34.65 
 
 		 582 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  32.06 
 
 		 589 aa  274  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  33.56 
 
 		 662 aa  274  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  32.65 
 
 		 593 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  33.27 
 
 		 599 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  36.75 
 
 		 437 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  34.03 
 
 		 648 aa  269  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  33.03 
 
 		 586 aa  268  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  33.27 
 
 		 645 aa  266  7e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  32.97 
 
 		 576 aa  266  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  32.92 
 
 		 604 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  32.73 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  32.3 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08826  gamma-glutamyltranspeptidase  33.33 
 
 		 563 aa  264  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  32.79 
 
 		 583 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  32.54 
 
 		 645 aa  261  3e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  33.39 
 
 		 616 aa  261  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  32.97 
 
 		 582 aa  259  8e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  34.24 
 
 		 586 aa  259  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  32.82 
 
 		 662 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  33.39 
 
 		 587 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  31.5 
 
 		 580 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  32.82 
 
 		 662 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  33.27 
 
 		 643 aa  258  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  32.5 
 
 		 587 aa  257  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  31.5 
 
 		 580 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  31.68 
 
 		 581 aa  257  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  31.68 
 
 		 580 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  34.15 
 
 		 579 aa  256  9e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4506  gamma-glutamyltransferase  30.92 
 
 		 560 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  32.23 
 
 		 583 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  33.1 
 
 		 587 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  33.09 
 
 		 583 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6704  putative gamma-glutamyltranspeptidase  32.41 
 
 		 557 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450418 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  32.55 
 
 		 617 aa  254  3e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  31.5 
 
 		 580 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  31.32 
 
 		 580 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  33.27 
 
 		 583 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  30.73 
 
 		 577 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  30.82 
 
 		 588 aa  253  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0909  gamma-glutamyltransferase 1  31.31 
 
 		 590 aa  253  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.591211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  31.32 
 
 		 580 aa  253  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  31.32 
 
 		 580 aa  253  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  30.89 
 
 		 581 aa  253  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  32.29 
 
 		 634 aa  253  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>