More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0970 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3535  gamma-glutamyltransferase  64.76 
 
 		 596 aa  759    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2921  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  73.73 
 
 		 623 aa  840    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3054  gamma-glutamyltransferase  63.99 
 
 		 596 aa  753    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1005  gamma-glutamyltranspeptidase  73.93 
 
 		 625 aa  954    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0422  gamma-glutamyltransferase  58.2 
 
 		 648 aa  651    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4764  gamma-glutamyltransferase 1  69.43 
 
 		 610 aa  815    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0674092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6223  gamma-glutamyltransferase 1  56.29 
 
 		 625 aa  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0970  gamma-glutamyltransferase 1  100 
 
 		 653 aa  1327    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160788  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2798  gamma-glutamyltransferase  57.07 
 
 		 626 aa  646    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  55.65 
 
 		 624 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2892  gamma-glutamyltransferase  56.14 
 
 		 624 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.50146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2936  gamma-glutamyltransferase  56.39 
 
 		 626 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444733  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2389  gamma-glutamyltransferase  64.02 
 
 		 596 aa  758    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2238  gamma-glutamyltransferase  64.58 
 
 		 598 aa  754    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  55.65 
 
 		 624 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1042  gamma-glutamyltransferase 1  52.58 
 
 		 623 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.103549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0960  gamma-glutamyltransferase  52.58 
 
 		 623 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0389  gamma-glutamyltransferase  56.51 
 
 		 629 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3237  gamma-glutamyltransferase  54.93 
 
 		 627 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.782882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0214  gamma-glutamyltransferase  54.93 
 
 		 627 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0467  gamma-glutamyltransferase  54.93 
 
 		 627 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.911304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0630  hypothetical protein  55.11 
 
 		 692 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2806  gamma-glutamyltransferase  54.93 
 
 		 627 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1379  gamma-glutamyltransferase  54.93 
 
 		 627 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0447  gamma-glutamyltransferase  54.93 
 
 		 626 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1410  gamma-glutamyltransferase 1  52.25 
 
 		 628 aa  560  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2560  gamma-glutamyltransferase  50 
 
 		 599 aa  561  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0623  gamma-glutamyltransferase  51.83 
 
 		 624 aa  551  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1607  gamma-glutamyltransferase  51.1 
 
 		 618 aa  549  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.607897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3094  gamma-glutamyltransferase 1  52.28 
 
 		 621 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12422  gamma-glutamyltranspeptidase precursor ggtB  47.96 
 
 		 643 aa  497  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3307  gamma-glutamyltransferase 1  47.55 
 
 		 669 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  49.31 
 
 		 595 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  49.14 
 
 		 593 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  47.32 
 
 		 586 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  47.62 
 
 		 586 aa  480  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  46.29 
 
 		 588 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  47.37 
 
 		 577 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1435  gamma-glutamyltransferase  45.62 
 
 		 662 aa  477  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.647396 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  45.42 
 
 		 581 aa  474  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  43.97 
 
 		 588 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1314  Gamma-glutamyltransferase  46.15 
 
 		 652 aa  468  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2546  gamma-glutamyltransferase  43.62 
 
 		 658 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2441  gamma-glutamyltransferase 1  46.78 
 
 		 634 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6695  gamma-glutamyltransferase  46.44 
 
 		 661 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2435  gamma-glutamyltransferase 1  46.78 
 
 		 634 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6219  gamma-glutamyltransferase  46.59 
 
 		 661 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5852  gamma-glutamyltransferase  46.59 
 
 		 661 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385279  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2394  gamma-glutamyltransferase 1  46.78 
 
 		 634 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50502  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  43.17 
 
 		 588 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6623  gamma-glutamyltransferase 1  46 
 
 		 691 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.189852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  48.76 
 
 		 596 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  44.71 
 
 		 580 aa  461  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1782  Gamma-glutamyltransferase  46.99 
 
 		 696 aa  461  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  45.08 
 
 		 586 aa  462  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5982  gamma-glutamyltransferase  44.89 
 
 		 662 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5335  gamma-glutamyltransferase  45.17 
 
 		 660 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  0.0291024 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5737  gamma-glutamyltransferase  44.53 
 
 		 662 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0740848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  48.83 
 
 		 588 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3716  gamma-glutamyltransferase  48.26 
 
 		 648 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1957  gamma-glutamyltranspeptidase  44.79 
 
 		 616 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000150594  normal  0.152366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  45.39 
 
 		 595 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  45.75 
 
 		 571 aa  420  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  45.8 
 
 		 583 aa  419  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  44.29 
 
 		 575 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0391  gamma-glutamyltransferase  42.42 
 
 		 572 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  43.53 
 
 		 619 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3459  gamma-glutamyltransferase  40.67 
 
 		 582 aa  389  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000240901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0482  gamma-glutamyltransferase 1  45.67 
 
 		 437 aa  360  4e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174178  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001611  gamma-glutamyltranspeptidase  37.39 
 
 		 576 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00725831  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0798  gamma-glutamyltransferase  36.11 
 
 		 578 aa  300  4e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.979487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1559  gamma-glutamyltransferase  38.86 
 
 		 590 aa  287  4e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311416  normal  0.15174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  38.09 
 
 		 579 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  35.11 
 
 		 589 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  36.28 
 
 		 606 aa  279  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  36.79 
 
 		 587 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  36.11 
 
 		 586 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  37.5 
 
 		 601 aa  275  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  35.31 
 
 		 580 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  39.25 
 
 		 595 aa  273  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0138  gamma-glutamyltransferase  35.52 
 
 		 570 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  37.32 
 
 		 614 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  34.81 
 
 		 580 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  35.03 
 
 		 580 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  35.03 
 
 		 580 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  35.56 
 
 		 581 aa  269  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  34.63 
 
 		 580 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  34.63 
 
 		 580 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  34.92 
 
 		 577 aa  268  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  34.63 
 
 		 580 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  34.75 
 
 		 578 aa  267  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  34.81 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  34.63 
 
 		 581 aa  267  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  35.14 
 
 		 580 aa  267  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  34.63 
 
 		 580 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  34.63 
 
 		 580 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  33.98 
 
 		 571 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  34.9 
 
 		 575 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  33.33 
 
 		 645 aa  263  6e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  33.5 
 
 		 593 aa  263  6.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>